More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1087 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1087  ferredoxin  100 
 
 		 125 aa  260  4e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1400  ferredoxin  82.79 
 
 		 122 aa  215  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.385733  normal  0.502771 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  63.33 
 
 		 121 aa  167  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08951  ferredoxin, PetF like protein  58.27 
 
 		 128 aa  156  7e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104451  hitchhiker  0.000234569 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0228  ferredoxin, PetF like protein  58.27 
 
 		 128 aa  156  7e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11908  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  60 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  0.00000103216 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  61.48 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  59.02 
 
 		 122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  56.56 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  58.2 
 
 		 122 aa  143  8.000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  57.38 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  57.38 
 
 		 122 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09611  ferredoxin, petF-like protein  53.23 
 
 		 124 aa  140  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.511459  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  56.56 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  50.82 
 
 		 124 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  56.3 
 
 		 121 aa  137  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09631  ferredoxin, petF-like protein  52.42 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0902  ferredoxin, petF-like protein  53.23 
 
 		 124 aa  135  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.180357  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9385  predicted protein  48.11 
 
 		 105 aa  96.3  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  43.69 
 
 		 104 aa  87.4  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  46.46 
 
 		 107 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  41.75 
 
 		 105 aa  87.4  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  38.68 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  43.4 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  43.12 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  43.4 
 
 		 105 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  42.42 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  45 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  37.38 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  39.8 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  36.45 
 
 		 108 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  36.45 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  40.82 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  36.73 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  38.24 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  38.14 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  38.14 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  38.14 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  36.08 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  36.08 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  42.17 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  37.11 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  36.08 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  35.29 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  36.08 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  38.54 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  36.08 
 
 		 99 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  36.08 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  40.24 
 
 		 89 aa  68.2  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  36.08 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  36.08 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_8944  predicted protein  37.37 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  46.97 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  34.02 
 
 		 99 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  37.5 
 
 		 100 aa  63.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  36.84 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  34 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  34 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0368  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.94 
 
 		 349 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000152179  unclonable  0.0000000536211 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  33 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  33.33 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  42.42 
 
 		 104 aa  60.1  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  38.75 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1779  ferredoxin  45.71 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10664  predicted protein  37.35 
 
 		 93 aa  57  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00108435  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  36.25 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  33.75 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  31.96 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0099  ferredoxin  44.12 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3231  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.74 
 
 		 420 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.836861 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  34.52 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  44.62 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0757  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.9 
 
 		 358 aa  53.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123298  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  34.83 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  43.86 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1377  ferredoxin  32.98 
 
 		 344 aa  53.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  40.3 
 
 		 268 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  41.54 
 
 		 373 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1737  ferredoxin  41.79 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4030  hypothetical protein  33.33 
 
 		 312 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0157718 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.57 
 
 		 348 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1591  hypothetical protein  30.77 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  34.72 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  33.75 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.67 
 
 		 385 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.31 
 
 		 343 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.39 
 
 		 343 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.71 
 
 		 340 aa  50.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  33.77 
 
 		 342 aa  50.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4338  oxidoreductase, iron-sulfur-binding protein  32.47 
 
 		 312 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.3 
 
 		 343 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2508  oxygenase, putative  32.05 
 
 		 324 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.663767  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1052  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.58 
 
 		 397 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.705726  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.23 
 
 		 382 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.23 
 
 		 382 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2176  ferredoxin  41.27 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.378228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2408  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.77 
 
 		 343 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.06 
 
 		 343 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.77 
 
 		 343 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2515  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.77 
 
 		 343 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>