More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1060 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 
102 aa  211  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  60.42 
 
 
99 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  60.42 
 
 
99 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  59.38 
 
 
99 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  59.38 
 
 
99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  58.33 
 
 
100 aa  124  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  58.33 
 
 
99 aa  124  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  59.38 
 
 
99 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  58.33 
 
 
99 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  57.29 
 
 
99 aa  121  4e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  57.29 
 
 
99 aa  121  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  57.29 
 
 
99 aa  120  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  58.33 
 
 
99 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  58.33 
 
 
99 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  58.33 
 
 
99 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  54.17 
 
 
99 aa  118  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  55.21 
 
 
98 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  55.21 
 
 
99 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  53.85 
 
 
104 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  57.29 
 
 
96 aa  113  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  53.61 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  50.49 
 
 
104 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  50.49 
 
 
104 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1089  ferredoxin (2Fe-2S)  50.98 
 
 
111 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  47.42 
 
 
99 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  52.63 
 
 
123 aa  107  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1059  ferredoxin (2Fe-2S)  47.06 
 
 
106 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  47.06 
 
 
106 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  46.32 
 
 
99 aa  103  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  51.11 
 
 
94 aa  102  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  46.88 
 
 
99 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  50 
 
 
103 aa  101  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  45.83 
 
 
99 aa  100  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  50.63 
 
 
94 aa  99  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  45.45 
 
 
98 aa  94  6e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  42.71 
 
 
106 aa  94  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  48.42 
 
 
97 aa  94  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  51.55 
 
 
268 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  44.44 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4258  ferredoxin (2Fe-2S)  48.45 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  41.58 
 
 
104 aa  90.9  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  41.18 
 
 
122 aa  90.1  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3940  ferredoxin (2Fe-2S)  46.88 
 
 
99 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1874  (2Fe-2S) ferredoxin  39.58 
 
 
106 aa  86.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  49.33 
 
 
88 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  41.41 
 
 
105 aa  84  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  39.22 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  39.22 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  39.22 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  39.22 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  40.2 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  38.24 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2296  ferredoxin (2Fe-2S)  42.57 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  42.86 
 
 
89 aa  77  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  39.39 
 
 
105 aa  77  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  38.61 
 
 
106 aa  77  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  35.35 
 
 
105 aa  76.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  36.27 
 
 
122 aa  77  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  35.35 
 
 
105 aa  76.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1567  ferredoxin (2Fe-2S)  43.68 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  40.66 
 
 
101 aa  74.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  43.04 
 
 
113 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0902  ferredoxin, petF-like protein  39.22 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.180357  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  36.63 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  0.00000103216 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.45 
 
 
358 aa  71.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.24 
 
 
348 aa  72  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  33.33 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  39.76 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  36.27 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09631  ferredoxin, petF-like protein  38.24 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09611  ferredoxin, petF-like protein  37.25 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.511459  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  36.47 
 
 
350 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1087  ferredoxin  35.29 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  44.3 
 
 
343 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10664  predicted protein  41.67 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00108435  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3646  ferredoxin  37.84 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  41.76 
 
 
415 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  41.25 
 
 
681 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0414  ferredoxin  39.02 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0596  ferredoxin  38.27 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  44.87 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  44.87 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0037  ferredoxin  38.27 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.92312  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1400  ferredoxin  34.31 
 
 
122 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.385733  normal  0.502771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  34.95 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  39.18 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  38.81 
 
 
379 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3637  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  43.06 
 
 
365 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  43.06 
 
 
360 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.81 
 
 
382 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.33 
 
 
351 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.11 
 
 
348 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  41.18 
 
 
379 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.71 
 
 
375 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.71 
 
 
381 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.13 
 
 
358 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1828  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  43.06 
 
 
362 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488384  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.67 
 
 
362 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4151  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.62 
 
 
358 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.522682  normal  0.83112 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.13 
 
 
358 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.367598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>