More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2108 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 
104 aa  214  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  76.7 
 
 
104 aa  171  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  76.7 
 
 
104 aa  171  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  75 
 
 
104 aa  164  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  67.33 
 
 
99 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  63.37 
 
 
99 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  63.37 
 
 
99 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  62.38 
 
 
99 aa  136  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  62.38 
 
 
99 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  63.27 
 
 
100 aa  130  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  61.22 
 
 
99 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  60.4 
 
 
99 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  60.4 
 
 
99 aa  128  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  60.4 
 
 
99 aa  128  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  59.41 
 
 
99 aa  126  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  60.4 
 
 
96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  57.43 
 
 
99 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  58.42 
 
 
99 aa  124  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  58.42 
 
 
99 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  58.42 
 
 
123 aa  122  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  58.42 
 
 
99 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  58.42 
 
 
99 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  60.2 
 
 
99 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  58.42 
 
 
99 aa  120  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  59.14 
 
 
98 aa  119  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  53.85 
 
 
102 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3940  ferredoxin (2Fe-2S)  65.35 
 
 
99 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4258  ferredoxin (2Fe-2S)  64.36 
 
 
99 aa  114  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  54.46 
 
 
103 aa  114  6e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  61.25 
 
 
99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  61.25 
 
 
99 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  54.12 
 
 
94 aa  110  9e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  52 
 
 
106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  48.98 
 
 
94 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  52.53 
 
 
97 aa  100  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  63.16 
 
 
98 aa  99.8  1e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  49.02 
 
 
268 aa  96.7  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1874  (2Fe-2S) ferredoxin  47 
 
 
106 aa  94.4  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  57.14 
 
 
88 aa  93.6  8e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  45.92 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  44 
 
 
104 aa  90.5  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1089  ferredoxin (2Fe-2S)  45.1 
 
 
111 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2296  ferredoxin (2Fe-2S)  47.12 
 
 
112 aa  87.8  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  45 
 
 
122 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  45 
 
 
122 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1059  ferredoxin (2Fe-2S)  43.14 
 
 
106 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  43 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  41 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  45.98 
 
 
106 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  46 
 
 
107 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  43.16 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  46.15 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  38 
 
 
122 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  46.15 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  48.72 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  46.84 
 
 
111 aa  77  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1567  ferredoxin (2Fe-2S)  45.12 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  45.83 
 
 
113 aa  74.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  42.22 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  41.3 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  41.3 
 
 
108 aa  73.6  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  44.59 
 
 
89 aa  73.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  44.59 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0037  ferredoxin  41.98 
 
 
200 aa  72  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.92312  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.29 
 
 
351 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  44.87 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  35.71 
 
 
350 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  38.46 
 
 
356 aa  71.2  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  46.75 
 
 
681 aa  70.9  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  45.83 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0596  ferredoxin  37.37 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0414  ferredoxin  43.9 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4884  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer component  45.45 
 
 
339 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.217527  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2756  ferredoxin  39.58 
 
 
111 aa  67  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.108856 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4405  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  45.45 
 
 
339 aa  66.6  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3076  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.66 
 
 
352 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.163455 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  34 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10664  predicted protein  39.76 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00108435  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2886  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase  43.28 
 
 
366 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00113682  decreased coverage  0.000127414 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  43.04 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.54 
 
 
351 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2143  ferredoxin  35 
 
 
344 aa  64.3  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000191342  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1087  ferredoxin  46.97 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1400  ferredoxin  46.97 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.385733  normal  0.502771 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  42.86 
 
 
321 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.65 
 
 
348 aa  63.9  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.67 
 
 
348 aa  63.9  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1779  ferredoxin  45.07 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0913  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer subunit BenC  41.56 
 
 
339 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  40.51 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  0.00000103216 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3646  ferredoxin  38.3 
 
 
128 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  42.86 
 
 
345 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1136  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40 
 
 
339 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9385  predicted protein  36.9 
 
 
105 aa  62  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5350  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.76 
 
 
340 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.213773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  43.66 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0217  ferredoxin  44.26 
 
 
357 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  38.67 
 
 
366 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>