More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1542 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 		 108 aa  224  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  83.33 
 
 		 108 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  83.33 
 
 		 108 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  50.93 
 
 		 109 aa  124  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  50 
 
 		 113 aa  120  8e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  50.48 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  49.02 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  47.62 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  48.04 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  43.14 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  43.14 
 
 		 105 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  44.12 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  45.1 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16281  ferredoxin  45.37 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.311771  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  44.04 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  44.12 
 
 		 111 aa  96.7  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  43.27 
 
 		 106 aa  95.1  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  44.76 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  44.76 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  43.12 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  41.67 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  43.12 
 
 		 122 aa  90.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  46.67 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  46.67 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  42.57 
 
 		 99 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  42.57 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  40 
 
 		 121 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  42.57 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  42.57 
 
 		 99 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  43.56 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0599  ferredoxin  50.68 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  43.18 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14011  hypothetical protein  50.68 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.908602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  41.84 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0902  ferredoxin, petF-like protein  41.18 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.180357  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  42.57 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  42.57 
 
 		 99 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09631  ferredoxin, petF-like protein  42.16 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09611  ferredoxin, petF-like protein  42.16 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.511459  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  42.05 
 
 		 94 aa  77  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9385  predicted protein  40.43 
 
 		 105 aa  76.6  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  42.86 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  40.4 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  41.58 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  41.58 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  44.32 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  40.59 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1400  ferredoxin  39.22 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.385733  normal  0.502771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  48.75 
 
 		 99 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  38.24 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  42.22 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  40.59 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  39.8 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  39 
 
 		 98 aa  73.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  39.6 
 
 		 99 aa  72  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 		 100 aa  72  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08951  ferredoxin, PetF like protein  36.52 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104451  hitchhiker  0.000234569 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0228  ferredoxin, PetF like protein  36.52 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11908  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  38.3 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  0.00000103216 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1087  ferredoxin  38.24 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  44.44 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  37.8 
 
 		 379 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  39.76 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  37.62 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  37.62 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4151  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.38 
 
 		 358 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.522682  normal  0.83112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.8 
 
 		 381 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.75 
 
 		 375 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.5 
 
 		 375 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.5 
 
 		 375 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  35.64 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_8944  predicted protein  36.73 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  35.63 
 
 		 99 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  46.15 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  39.18 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  39.53 
 
 		 356 aa  64.3  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.36 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.78 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.78 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.78 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.78 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.78 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.36 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.78 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.78 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.36 
 
 		 358 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.78 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  40.66 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.36 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  36.25 
 
 		 89 aa  62  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  36.25 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.31 
 
 		 352 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.23 
 
 		 358 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  34.34 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5112  ferredoxin  36.78 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528807  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  34.18 
 
 		 382 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2143  ferredoxin  33.75 
 
 		 344 aa  58.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000191342  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.18 
 
 		 382 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.48 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.18 
 
 		 382 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>