More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1008 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 
94 aa  187  4e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  71.28 
 
 
94 aa  144  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  64.58 
 
 
103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  56.25 
 
 
123 aa  124  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  56.12 
 
 
99 aa  117  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  57.29 
 
 
99 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  57.29 
 
 
98 aa  117  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  58.33 
 
 
100 aa  116  7.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  57.14 
 
 
99 aa  115  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  57.14 
 
 
99 aa  115  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  57.29 
 
 
99 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  58.16 
 
 
99 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  57.14 
 
 
99 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  58.16 
 
 
99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  58.16 
 
 
99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  56.12 
 
 
99 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  57.14 
 
 
99 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  57.14 
 
 
99 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  57.14 
 
 
99 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  53.06 
 
 
99 aa  113  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  53.06 
 
 
99 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  54.74 
 
 
98 aa  110  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  46.46 
 
 
104 aa  107  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  48.98 
 
 
104 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  56.47 
 
 
88 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  51.04 
 
 
96 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  45.26 
 
 
99 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  53.85 
 
 
99 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  51.28 
 
 
104 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  52.27 
 
 
268 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  50.63 
 
 
102 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  51.28 
 
 
104 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  47.92 
 
 
97 aa  95.5  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  45.92 
 
 
99 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  51.25 
 
 
99 aa  94  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  42.71 
 
 
106 aa  87.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  45.16 
 
 
105 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  45.16 
 
 
105 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  44.09 
 
 
104 aa  85.1  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1567  ferredoxin (2Fe-2S)  43.82 
 
 
98 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3940  ferredoxin (2Fe-2S)  45.26 
 
 
99 aa  84  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  42.71 
 
 
105 aa  83.6  8e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  46.81 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  45.16 
 
 
107 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1059  ferredoxin (2Fe-2S)  42.53 
 
 
106 aa  79.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2296  ferredoxin (2Fe-2S)  48.84 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  42.55 
 
 
109 aa  79.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  43.04 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  41.67 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  40.22 
 
 
111 aa  77.4  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  46.59 
 
 
108 aa  77  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  42.05 
 
 
108 aa  77  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  45.45 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  41.25 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  47.14 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4258  ferredoxin (2Fe-2S)  38.95 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  37.11 
 
 
121 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1089  ferredoxin (2Fe-2S)  43.24 
 
 
111 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  34.74 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  42.67 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1874  (2Fe-2S) ferredoxin  31.25 
 
 
106 aa  70.1  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  38.75 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  38.75 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  41.33 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  45.45 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  35.16 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  41.1 
 
 
379 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  36 
 
 
89 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  36 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  39.02 
 
 
681 aa  65.5  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0414  ferredoxin  39.29 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.93 
 
 
338 aa  64.7  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  37.93 
 
 
338 aa  64.7  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.06 
 
 
375 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  38.57 
 
 
350 aa  63.2  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  36.25 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0599  ferredoxin  40 
 
 
104 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0037  ferredoxin  34.52 
 
 
200 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.92312  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0381  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  46.77 
 
 
365 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.155408  hitchhiker  0.00902786 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.36 
 
 
385 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  37.35 
 
 
381 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.36 
 
 
375 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10664  predicted protein  38.37 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00108435  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14011  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.908602  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.36 
 
 
375 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.47 
 
 
342 aa  61.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  37.35 
 
 
380 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0932  ferredoxin  45.9 
 
 
358 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.84 
 
 
358 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  40 
 
 
380 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.93 
 
 
340 aa  60.8  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.84 
 
 
358 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4468  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.98 
 
 
369 aa  60.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.488012  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.89 
 
 
357 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.14 
 
 
382 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.78 
 
 
345 aa  60.5  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  40 
 
 
379 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  33.73 
 
 
356 aa  60.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.5 
 
 
352 aa  60.1  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>