298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1400 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1400  ferredoxin  100 
 
 
122 aa  252  9e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.385733  normal  0.502771 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1087  ferredoxin  82.79 
 
 
125 aa  215  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  64.17 
 
 
121 aa  170  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0228  ferredoxin, PetF like protein  59.84 
 
 
128 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11908  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08951  ferredoxin, PetF like protein  59.84 
 
 
128 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104451  hitchhiker  0.000234569 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  59.17 
 
 
121 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  0.00000103216 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  59.02 
 
 
122 aa  147  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  59.84 
 
 
122 aa  147  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  59.84 
 
 
122 aa  144  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  59.84 
 
 
122 aa  142  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09611  ferredoxin, petF-like protein  52.46 
 
 
124 aa  142  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.511459  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  51.64 
 
 
124 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  56.56 
 
 
122 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  56.56 
 
 
122 aa  140  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09631  ferredoxin, petF-like protein  51.64 
 
 
124 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0902  ferredoxin, petF-like protein  53.28 
 
 
124 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.180357  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  53.28 
 
 
122 aa  131  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  55.46 
 
 
121 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9385  predicted protein  51.4 
 
 
105 aa  110  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  45.63 
 
 
104 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  46.46 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  39.81 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  40.78 
 
 
105 aa  84  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  44.44 
 
 
111 aa  83.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  43.3 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  43.3 
 
 
105 aa  81.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  39.18 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  41.41 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  45 
 
 
113 aa  78.2  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  40.21 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  40.21 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  40.21 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  37.38 
 
 
108 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  38.14 
 
 
99 aa  77  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  37.38 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  37.38 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  39.22 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  37.76 
 
 
99 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  37.11 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  38.14 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  37.11 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  37.11 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  39.18 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  38.14 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  39.18 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  38.78 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  35.05 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  36.73 
 
 
99 aa  70.1  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  37.5 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  34.31 
 
 
102 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  38.2 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_8944  predicted protein  36.36 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268011  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  39.53 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  34.02 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  46.97 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  39.24 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  39.24 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  34.02 
 
 
99 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  34.38 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  36.96 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  33 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0368  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.75 
 
 
349 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000152179  unclonable  0.0000000536211 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1779  ferredoxin  40.45 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  42.42 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1377  ferredoxin  39.51 
 
 
344 aa  57.8  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  34.62 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  44.26 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10664  predicted protein  40.54 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00108435  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  38.46 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  34.74 
 
 
94 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0099  ferredoxin  44.12 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  40.54 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  35.44 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  34.15 
 
 
754 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4923  ferredoxin  44 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4404  ferredoxin  44 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  47.37 
 
 
268 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3447  ferredoxin  32.22 
 
 
340 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1591  hypothetical protein  30.23 
 
 
146 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  35 
 
 
99 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1737  ferredoxin  43.08 
 
 
129 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  43.08 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.37 
 
 
343 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3231  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.18 
 
 
420 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412969  normal  0.836861 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1820  2Fe-2S iron-sulfur  38.89 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0798  iron-sulfur cluster-binding protein  38.89 
 
 
96 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2159  2Fe-2S iron-sulfur  38.89 
 
 
96 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  38.24 
 
 
319 aa  50.1  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0888  2Fe-2S iron-sulfur  38.89 
 
 
96 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225976  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  38.46 
 
 
373 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2756  ferredoxin  41.33 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.108856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5307  ferredoxin  38.82 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.786726  normal  0.0713222 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.39 
 
 
343 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0697  ferredoxin  38.82 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812143  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.37 
 
 
343 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3387  ferredoxin  38.82 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.864897  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  33.77 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2176  ferredoxin  42.86 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.378228  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4980  ferredoxin  38.82 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786925  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>