More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5208 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  100 
 
 
382 aa  796    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  84.46 
 
 
385 aa  683    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  87.17 
 
 
380 aa  697    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  85.6 
 
 
382 aa  685    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  86.65 
 
 
380 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  86.68 
 
 
381 aa  697    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  84.64 
 
 
386 aa  677    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  87.21 
 
 
381 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  95.81 
 
 
382 aa  768    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  87.17 
 
 
379 aa  686    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  97.12 
 
 
382 aa  776    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  99.48 
 
 
382 aa  793    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  97.12 
 
 
382 aa  776    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  86.65 
 
 
380 aa  694    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  99.48 
 
 
382 aa  793    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  86.53 
 
 
380 aa  697    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  86.65 
 
 
380 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  93.98 
 
 
382 aa  756    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  73.43 
 
 
414 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  71.53 
 
 
418 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  53.65 
 
 
375 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  54.19 
 
 
381 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  53.7 
 
 
375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  52.24 
 
 
375 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  53.24 
 
 
379 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  53.72 
 
 
394 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  51.36 
 
 
383 aa  389  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  54.08 
 
 
363 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  50.91 
 
 
381 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46.85 
 
 
356 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.32 
 
 
363 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  46.41 
 
 
366 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  46.41 
 
 
366 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.69 
 
 
396 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.23 
 
 
367 aa  328  7e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  48.26 
 
 
366 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.47 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  47.8 
 
 
366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  44.35 
 
 
366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  46.85 
 
 
368 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.36 
 
 
366 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  45.21 
 
 
372 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.93 
 
 
368 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.08 
 
 
366 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  44.16 
 
 
364 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  43.98 
 
 
365 aa  311  1e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  43.79 
 
 
358 aa  309  6.999999999999999e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  43.25 
 
 
355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  43.63 
 
 
362 aa  305  7e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  42.47 
 
 
372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  42.37 
 
 
355 aa  297  3e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  43.49 
 
 
353 aa  289  7e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5978  ferredoxin  40.8 
 
 
364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.430172  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.42 
 
 
361 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.49 
 
 
374 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.88 
 
 
380 aa  272  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.17 
 
 
380 aa  272  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.45 
 
 
376 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.71 
 
 
371 aa  268  8e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.06 
 
 
387 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.77 
 
 
406 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  40 
 
 
365 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.34 
 
 
388 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  39.22 
 
 
606 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  39.22 
 
 
606 aa  255  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.94 
 
 
367 aa  255  8e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  39.01 
 
 
356 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.75 
 
 
407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  41.1 
 
 
325 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.78 
 
 
403 aa  241  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  33.33 
 
 
373 aa  215  9e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  35.16 
 
 
662 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.41 
 
 
585 aa  202  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  32.86 
 
 
585 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  35.25 
 
 
351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  30.97 
 
 
605 aa  195  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  31.28 
 
 
627 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.1 
 
 
342 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  31.41 
 
 
605 aa  189  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.2 
 
 
702 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  31.58 
 
 
597 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  32.97 
 
 
625 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  31.75 
 
 
670 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.05 
 
 
356 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32 
 
 
345 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.62 
 
 
669 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.21 
 
 
688 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.84 
 
 
351 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.1 
 
 
677 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  31.9 
 
 
376 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  31.99 
 
 
376 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  31.99 
 
 
376 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  31.98 
 
 
380 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0217  ferredoxin  31.61 
 
 
357 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1462  ferredoxin  31.41 
 
 
358 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611989  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13604  hemoglobine-related protein hmp  32.68 
 
 
358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.714491  normal  0.806459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  32.57 
 
 
352 aa  166  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.5 
 
 
334 aa  166  6.9999999999999995e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2520  ferredoxin  32.45 
 
 
366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4186  ferredoxin  29.36 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>