More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2581 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 
122 aa  249  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  69.67 
 
 
122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  70.49 
 
 
122 aa  178  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  66.39 
 
 
122 aa  176  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  71.43 
 
 
121 aa  176  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  65.57 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  63.11 
 
 
122 aa  167  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  63.11 
 
 
122 aa  167  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1087  ferredoxin  56.56 
 
 
125 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0902  ferredoxin, petF-like protein  49.18 
 
 
124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.180357  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1400  ferredoxin  53.28 
 
 
122 aa  131  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.385733  normal  0.502771 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09631  ferredoxin, petF-like protein  50 
 
 
124 aa  131  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09611  ferredoxin, petF-like protein  50 
 
 
124 aa  130  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.511459  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  47.5 
 
 
121 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  47.54 
 
 
124 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  52.83 
 
 
104 aa  120  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  42.5 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  0.00000103216 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9385  predicted protein  50.48 
 
 
105 aa  114  6e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  48.6 
 
 
107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  49.04 
 
 
105 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  49.04 
 
 
105 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08951  ferredoxin, PetF like protein  40.94 
 
 
128 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104451  hitchhiker  0.000234569 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0228  ferredoxin, PetF like protein  40.94 
 
 
128 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  44.95 
 
 
111 aa  103  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  47.17 
 
 
105 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  47.17 
 
 
106 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  45.1 
 
 
108 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  44.66 
 
 
105 aa  97.4  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  41.12 
 
 
109 aa  94.7  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  43.3 
 
 
99 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  43.3 
 
 
99 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  41.35 
 
 
113 aa  91.7  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  41.24 
 
 
99 aa  91.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  39.62 
 
 
108 aa  91.3  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  39.62 
 
 
108 aa  90.9  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  41.24 
 
 
99 aa  90.5  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  41.18 
 
 
102 aa  90.1  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  49.38 
 
 
98 aa  90.1  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  41.24 
 
 
99 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  47.56 
 
 
99 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  47.56 
 
 
99 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  47.56 
 
 
99 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  41.24 
 
 
99 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  42.27 
 
 
99 aa  88.2  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  43.3 
 
 
99 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  40.21 
 
 
99 aa  87.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  40.21 
 
 
99 aa  87.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  39 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  39 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  41.24 
 
 
99 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  41.24 
 
 
99 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  41 
 
 
104 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  39.18 
 
 
104 aa  81.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  39.13 
 
 
99 aa  80.1  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  38.71 
 
 
99 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  44.44 
 
 
123 aa  78.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  39.58 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  41.98 
 
 
94 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  40.74 
 
 
99 aa  77  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  40.74 
 
 
99 aa  77  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  37.11 
 
 
106 aa  76.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  37.5 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  37.5 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  43.24 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  43.24 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  36.25 
 
 
98 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1089  ferredoxin (2Fe-2S)  35.29 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  39.58 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  33.93 
 
 
268 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  34.74 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  37.18 
 
 
88 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  36.47 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2296  ferredoxin (2Fe-2S)  38 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1874  (2Fe-2S) ferredoxin  32.99 
 
 
106 aa  67.4  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_8944  predicted protein  34 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268011  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1059  ferredoxin (2Fe-2S)  37.5 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  37.5 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1591  hypothetical protein  38.2 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14011  hypothetical protein  34.38 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.908602  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.2 
 
 
351 aa  63.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0599  ferredoxin  34.38 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3940  ferredoxin (2Fe-2S)  38.71 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4258  ferredoxin (2Fe-2S)  39.78 
 
 
99 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.99 
 
 
348 aa  62.8  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1615  ferredoxin  43.28 
 
 
218 aa  61.6  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.640152 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.55 
 
 
348 aa  61.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0452  heat shock protein DnaJ domain protein  44.29 
 
 
209 aa  60.1  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.56 
 
 
343 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.56 
 
 
343 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.56 
 
 
343 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.56 
 
 
343 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.56 
 
 
343 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.56 
 
 
343 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.56 
 
 
343 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  39.24 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10664  predicted protein  37.04 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00108435  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.56 
 
 
343 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.02 
 
 
348 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.36 
 
 
338 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  38.36 
 
 
338 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>