22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_16281 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_16281  ferredoxin  100 
 
 
103 aa  213  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.311771  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  48.15 
 
 
108 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  48.15 
 
 
108 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  45.37 
 
 
108 aa  97.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  31.48 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  31.48 
 
 
113 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  32.04 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  26.67 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  30.3 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  29 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  24.51 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  30 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  30 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  23.81 
 
 
122 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  30.56 
 
 
105 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  26 
 
 
106 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  27.36 
 
 
122 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  26.61 
 
 
122 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  27.36 
 
 
122 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  28.77 
 
 
122 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14011  hypothetical protein  27.91 
 
 
104 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.908602  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0599  ferredoxin  27.91 
 
 
104 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>