More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_16511 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  100 
 
 
108 aa  220  4e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  99.07 
 
 
108 aa  219  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  83.33 
 
 
108 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  54.29 
 
 
109 aa  130  7.999999999999999e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  53.33 
 
 
113 aa  125  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  51.43 
 
 
107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  50 
 
 
104 aa  110  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  46 
 
 
105 aa  106  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  46 
 
 
105 aa  106  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  46.67 
 
 
105 aa  106  9.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  47.17 
 
 
105 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16281  ferredoxin  48.15 
 
 
103 aa  102  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.311771  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  45.1 
 
 
111 aa  99.4  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  43.27 
 
 
106 aa  97.4  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  39.62 
 
 
122 aa  91.3  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  43.01 
 
 
122 aa  90.5  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  40.95 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  40.95 
 
 
122 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  39.81 
 
 
121 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  41.49 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0599  ferredoxin  48.84 
 
 
104 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14011  hypothetical protein  48.84 
 
 
104 aa  84  6e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.908602  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  45.92 
 
 
103 aa  84  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  41.94 
 
 
122 aa  83.6  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  54.79 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  54.79 
 
 
104 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  38.1 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  51.9 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  50.63 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  50.63 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  50.63 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  42.86 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  49.37 
 
 
99 aa  77.4  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  46.59 
 
 
94 aa  77  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  44.21 
 
 
99 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  44.21 
 
 
99 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1400  ferredoxin  37.38 
 
 
122 aa  77  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.385733  normal  0.502771 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  40.4 
 
 
98 aa  76.3  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  40.22 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  50.63 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  50.63 
 
 
99 aa  74.7  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  48.75 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  37.37 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  50.63 
 
 
99 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1087  ferredoxin  36.45 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0902  ferredoxin, petF-like protein  42.35 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.180357  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  41.24 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  41.3 
 
 
104 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  48.1 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  37.5 
 
 
121 aa  72  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  41.24 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09631  ferredoxin, petF-like protein  38.24 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  38.95 
 
 
100 aa  71.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  39.36 
 
 
98 aa  70.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09611  ferredoxin, petF-like protein  38.24 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.511459  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  40.23 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08951  ferredoxin, PetF like protein  35.34 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.104451  hitchhiker  0.000234569 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0228  ferredoxin, PetF like protein  35.34 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11908  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  39.76 
 
 
88 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  43.69 
 
 
268 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  42.47 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  37.23 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  0.00000103216 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9385  predicted protein  40 
 
 
105 aa  67  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_8944  predicted protein  36.73 
 
 
103 aa  67  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268011  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  44.87 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  37.11 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  37.63 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  34.74 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  44.3 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  38.1 
 
 
379 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  44.3 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0984  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.78 
 
 
330 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386753 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  39.51 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.02 
 
 
375 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  37.5 
 
 
89 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.8 
 
 
375 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.8 
 
 
375 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  37.5 
 
 
101 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.5 
 
 
381 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.8 
 
 
356 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0860  iron-sulfur cluster-binding protein/oxidoreductase, FAD/NAD-binding  39.77 
 
 
327 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.451181  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.8 
 
 
363 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.44 
 
 
352 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4151  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.55 
 
 
358 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.522682  normal  0.83112 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.57 
 
 
382 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.52 
 
 
414 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.33 
 
 
386 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.73 
 
 
343 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.73 
 
 
343 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.73 
 
 
343 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.73 
 
 
343 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.73 
 
 
343 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  37.8 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.73 
 
 
343 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.18 
 
 
380 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.73 
 
 
343 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  33.33 
 
 
418 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.73 
 
 
343 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1656  ferredoxin/oxidoreductase, FAD/NAD-binding  34.83 
 
 
342 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.91 
 
 
380 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>