More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_05261 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  100 
 
 
99 aa  201  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  94.95 
 
 
99 aa  196  7e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  94.95 
 
 
99 aa  196  7e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  93.94 
 
 
99 aa  189  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  93.94 
 
 
99 aa  189  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  93.94 
 
 
99 aa  189  8e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  91.92 
 
 
99 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  90.91 
 
 
99 aa  187  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  82.83 
 
 
99 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  81.82 
 
 
99 aa  170  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  79.8 
 
 
99 aa  170  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  81.82 
 
 
99 aa  170  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  80.81 
 
 
99 aa  170  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  79.8 
 
 
99 aa  169  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  77.78 
 
 
99 aa  164  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  75 
 
 
100 aa  162  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  73.74 
 
 
98 aa  151  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  73.74 
 
 
123 aa  150  5e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  63.64 
 
 
99 aa  140  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  62.63 
 
 
99 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  72.45 
 
 
103 aa  139  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  65.31 
 
 
96 aa  132  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  64.29 
 
 
94 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  59.41 
 
 
104 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  58.82 
 
 
104 aa  124  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  57.73 
 
 
104 aa  123  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  57.73 
 
 
104 aa  123  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  60.61 
 
 
98 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  58.33 
 
 
102 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  55.79 
 
 
99 aa  121  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  56.12 
 
 
99 aa  120  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  54.55 
 
 
106 aa  116  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  56.57 
 
 
97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  57.14 
 
 
94 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  62.65 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1874  (2Fe-2S) ferredoxin  48.48 
 
 
106 aa  110  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  58.16 
 
 
268 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  53.61 
 
 
106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1089  ferredoxin (2Fe-2S)  52.53 
 
 
111 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3940  ferredoxin (2Fe-2S)  58.95 
 
 
99 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1059  ferredoxin (2Fe-2S)  53.61 
 
 
106 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2296  ferredoxin (2Fe-2S)  60.98 
 
 
112 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4258  ferredoxin (2Fe-2S)  51.02 
 
 
99 aa  97.1  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  43.75 
 
 
122 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  43.75 
 
 
122 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  44.33 
 
 
104 aa  90.9  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1567  ferredoxin (2Fe-2S)  52.38 
 
 
98 aa  90.5  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  44.44 
 
 
105 aa  89.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  41.24 
 
 
122 aa  89.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  38.38 
 
 
121 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  47.13 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  50.56 
 
 
107 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  47.13 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  37.37 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  40.21 
 
 
122 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  41 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  39 
 
 
122 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0414  ferredoxin  45.16 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  46.59 
 
 
111 aa  82  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  43.3 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  43.43 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  44.58 
 
 
350 aa  80.1  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  45.05 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0037  ferredoxin  39.78 
 
 
200 aa  79  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.92312  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  48.05 
 
 
351 aa  77.4  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  37.5 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  41.58 
 
 
108 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0596  ferredoxin  45 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  46.58 
 
 
89 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  46.58 
 
 
101 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  43.56 
 
 
108 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1400  ferredoxin  38.14 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.385733  normal  0.502771 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  40.86 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  50.63 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  52.31 
 
 
351 aa  74.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10664  predicted protein  41.86 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00108435  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  40.43 
 
 
121 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  0.00000103216 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3076  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.86 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.163455 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  38.55 
 
 
356 aa  72.8  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  41.38 
 
 
366 aa  72.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0508  ferredoxin  49.3 
 
 
350 aa  72  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.303507 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1779  ferredoxin  49.3 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  46.67 
 
 
360 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  41.46 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.48 
 
 
358 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  49.3 
 
 
681 aa  71.2  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4880  ferredoxin  50.75 
 
 
350 aa  70.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.30814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2869  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase paaE  42.67 
 
 
337 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.236927 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.53 
 
 
357 aa  70.5  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  44.16 
 
 
343 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  47.89 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3637  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  42.67 
 
 
365 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1828  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  44 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488384  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.48 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0900  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  43.24 
 
 
389 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.7 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.33 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_9385  predicted protein  41.98 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  44 
 
 
362 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0377  ferredoxin  39.33 
 
 
350 aa  68.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.88135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>