More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4176 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  100 
 
 
94 aa  190  5e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  45.74 
 
 
104 aa  87.4  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  46.81 
 
 
106 aa  84.3  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  47.25 
 
 
99 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  47.25 
 
 
99 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  47.25 
 
 
99 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  45.16 
 
 
99 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  47.87 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  45.05 
 
 
99 aa  80.1  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  46.15 
 
 
99 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  46.15 
 
 
99 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  45.05 
 
 
99 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0596  ferredoxin  46.39 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  45.05 
 
 
99 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  45.05 
 
 
99 aa  78.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  42.86 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0037  ferredoxin  40.62 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.92312  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  43.01 
 
 
100 aa  77.4  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0414  ferredoxin  42.86 
 
 
193 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  41.49 
 
 
105 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  44.09 
 
 
99 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  45.88 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  45.16 
 
 
111 aa  76.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  43.62 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  43.62 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1430  ferredoxin  47.78 
 
 
113 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  52 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0882  ferredoxin  45.56 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0891946  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  44.71 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2296  ferredoxin (2Fe-2S)  43.33 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  42.86 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  38.95 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  48.84 
 
 
101 aa  73.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  40.86 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  47.67 
 
 
89 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  40.86 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  41.46 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  44.87 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  39.58 
 
 
122 aa  70.9  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  44.3 
 
 
99 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  43.59 
 
 
98 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3126  ferredoxin  43.33 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.60134  normal  0.595667 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  43.84 
 
 
88 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  44.87 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  40.66 
 
 
99 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  40.66 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1376  ferredoxin  43.33 
 
 
111 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2779  ferredoxin  40 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.643117  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  35.42 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  35.79 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  35.16 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  44.93 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  37.36 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  42.31 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  42.31 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  43.59 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  36.46 
 
 
122 aa  63.5  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  43.59 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  37.63 
 
 
113 aa  63.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  35.48 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  49.25 
 
 
268 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  36.36 
 
 
97 aa  62  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  36.96 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1389  ferredoxin  37.93 
 
 
97 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3646  ferredoxin  35.58 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.71 
 
 
367 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  35.42 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  37.8 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  35.71 
 
 
319 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.96 
 
 
342 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  36.9 
 
 
366 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  37.8 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.9 
 
 
366 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.94 
 
 
345 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4258  ferredoxin (2Fe-2S)  37.89 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1089  ferredoxin (2Fe-2S)  39.18 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  38.82 
 
 
394 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.46 
 
 
338 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  38.46 
 
 
338 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.37 
 
 
396 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.78 
 
 
352 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.42 
 
 
669 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  42.65 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  37.04 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  36.46 
 
 
343 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.24 
 
 
344 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3648  ferredoxin  34.62 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3940  ferredoxin (2Fe-2S)  43.75 
 
 
99 aa  58.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  40 
 
 
350 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.63 
 
 
381 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08810  Phenol hydroxylase, Ferredoxin subunit  42.22 
 
 
353 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4353  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.96 
 
 
331 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  49.3 
 
 
681 aa  57.4  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  34.41 
 
 
121 aa  57.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  36.59 
 
 
108 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  37.5 
 
 
106 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0377  ferredoxin  39.73 
 
 
350 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.46 
 
 
343 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  42.17 
 
 
606 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  42.17 
 
 
606 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>