More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1088 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 
106 aa  220  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1059  ferredoxin (2Fe-2S)  98.11 
 
 
106 aa  215  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1089  ferredoxin (2Fe-2S)  63.37 
 
 
111 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  54.17 
 
 
99 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  53.12 
 
 
99 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  54.64 
 
 
99 aa  110  9e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  54.64 
 
 
99 aa  110  9e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  53.61 
 
 
99 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  51.58 
 
 
99 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  52.58 
 
 
99 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  52.58 
 
 
99 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  51.58 
 
 
99 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  52.58 
 
 
99 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  52.58 
 
 
99 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  47.06 
 
 
102 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  52.58 
 
 
99 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  51.04 
 
 
99 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  48.42 
 
 
100 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  51.04 
 
 
99 aa  101  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  46.88 
 
 
99 aa  93.2  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  44.66 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  44.66 
 
 
104 aa  89.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  49.47 
 
 
98 aa  87.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  41.67 
 
 
106 aa  87  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1874  (2Fe-2S) ferredoxin  40.62 
 
 
106 aa  87  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  45.45 
 
 
99 aa  86.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  49.4 
 
 
96 aa  84.3  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  41.41 
 
 
99 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  41.41 
 
 
99 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  45.98 
 
 
104 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  44.79 
 
 
123 aa  82.4  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  40.82 
 
 
99 aa  81.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  46.39 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  39.81 
 
 
104 aa  80.1  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  41.67 
 
 
94 aa  77.8  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  35.92 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  46.15 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  43.96 
 
 
105 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  38.3 
 
 
104 aa  70.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  40.23 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  43.68 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  43.68 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  38.71 
 
 
97 aa  67.8  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  39.39 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3940  ferredoxin (2Fe-2S)  42.42 
 
 
99 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4258  ferredoxin (2Fe-2S)  40.4 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  43.42 
 
 
88 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0902  ferredoxin, petF-like protein  35.51 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.180357  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  37.5 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  43.84 
 
 
350 aa  62.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  43.37 
 
 
268 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  45.21 
 
 
89 aa  62  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  45.21 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09631  ferredoxin, petF-like protein  35.51 
 
 
124 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09611  ferredoxin, petF-like protein  37.25 
 
 
124 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.511459  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  32.29 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.25 
 
 
343 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3646  ferredoxin  38.71 
 
 
128 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10664  predicted protein  41.77 
 
 
93 aa  60.1  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00108435  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.84 
 
 
344 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  33.68 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  38.2 
 
 
681 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  33.33 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  33.33 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2253  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.33 
 
 
356 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1479  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.33 
 
 
356 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  35.71 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2263  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.33 
 
 
356 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.379907  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1577  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.33 
 
 
356 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.65 
 
 
360 aa  57.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3637  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.14 
 
 
365 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  37.5 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.26 
 
 
356 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0599  ferredoxin  37.08 
 
 
104 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  36.46 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0900  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.67 
 
 
389 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  33.68 
 
 
122 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14011  hypothetical protein  37.08 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.908602  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  35.16 
 
 
379 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  35.53 
 
 
342 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1828  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.14 
 
 
362 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488384  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.16 
 
 
363 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  39.77 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  35 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  0.00000103216 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  37.21 
 
 
366 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.44 
 
 
343 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0932  ferredoxin  32.69 
 
 
358 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  36.14 
 
 
333 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0037  ferredoxin  34.38 
 
 
200 aa  55.1  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.92312  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.2 
 
 
341 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0596  ferredoxin  37.8 
 
 
193 aa  54.7  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.56 
 
 
343 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.07 
 
 
385 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2176  ferredoxin  36.59 
 
 
130 aa  54.7  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.378228  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.22 
 
 
343 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.22 
 
 
343 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.22 
 
 
343 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.22 
 
 
343 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.22 
 
 
343 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.69 
 
 
358 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.234643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>