More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1089 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1089  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 
111 aa  224  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1059  ferredoxin (2Fe-2S)  64.36 
 
 
106 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  63.37 
 
 
106 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  55.56 
 
 
99 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  54.55 
 
 
99 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  54.55 
 
 
99 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  54.55 
 
 
99 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  52.53 
 
 
99 aa  107  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  52.53 
 
 
99 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  50.98 
 
 
102 aa  107  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  50.51 
 
 
99 aa  107  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  50.51 
 
 
99 aa  107  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  51.52 
 
 
99 aa  107  8.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  52.53 
 
 
99 aa  105  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  52.04 
 
 
99 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  51.52 
 
 
99 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  51.52 
 
 
99 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  51.52 
 
 
99 aa  103  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  50.51 
 
 
99 aa  103  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  49.49 
 
 
99 aa  103  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  48.98 
 
 
100 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  52.04 
 
 
96 aa  96.3  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  46.24 
 
 
99 aa  95.5  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  50 
 
 
98 aa  94.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  44 
 
 
106 aa  92  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  45.1 
 
 
104 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  45.92 
 
 
123 aa  89  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1874  (2Fe-2S) ferredoxin  41.41 
 
 
106 aa  87.8  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4258  ferredoxin (2Fe-2S)  51.06 
 
 
99 aa  86.3  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  40.4 
 
 
99 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  44.9 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  40.4 
 
 
99 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  44.9 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  43.88 
 
 
104 aa  85.5  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3940  ferredoxin (2Fe-2S)  46.81 
 
 
99 aa  78.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  48.65 
 
 
94 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  48.05 
 
 
98 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  37.76 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  34.31 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  35.29 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  37.76 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  45.78 
 
 
268 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  43.24 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  36.36 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  41.18 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  41.18 
 
 
105 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  38.82 
 
 
88 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  35.35 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  37.61 
 
 
111 aa  67  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.42 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  37.25 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  34 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4468  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.48 
 
 
369 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.488012  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2296  ferredoxin (2Fe-2S)  46.15 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  47.22 
 
 
336 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  46.05 
 
 
333 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  45.45 
 
 
89 aa  62.8  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  45.45 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0596  ferredoxin  39.02 
 
 
193 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4069  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.29 
 
 
369 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.194384 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35 
 
 
343 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  35.29 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  32.35 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  32.35 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  40.79 
 
 
373 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.95 
 
 
356 aa  61.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0792  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.41 
 
 
343 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.29 
 
 
348 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.51 
 
 
342 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1966  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.41 
 
 
343 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0683406  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0878  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.41 
 
 
343 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000381375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1151  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.41 
 
 
343 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0655371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0997  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.41 
 
 
343 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0270  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.41 
 
 
343 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0393986  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0990  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.41 
 
 
343 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0155808  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0947  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.41 
 
 
343 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.438279  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.41 
 
 
343 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3648  ferredoxin  35.42 
 
 
126 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  39.18 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  34.38 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3076  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.77 
 
 
352 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.163455 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0414  ferredoxin  35.37 
 
 
193 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5822  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.41 
 
 
343 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  0.0803192 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.36 
 
 
342 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  40.58 
 
 
366 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0037  ferredoxin  32.65 
 
 
200 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.92312  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3646  ferredoxin  36.26 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4884  benzoate 1,2-dioxygenase electron transfer component  39.47 
 
 
339 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.217527  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.84 
 
 
344 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.41 
 
 
343 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10664  predicted protein  41.56 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00108435  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2408  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.41 
 
 
343 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.47 
 
 
345 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2515  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.41 
 
 
343 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3637  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.37 
 
 
365 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1879  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.41 
 
 
343 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36 
 
 
357 aa  58.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2490  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.41 
 
 
343 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2253  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.45 
 
 
356 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  34.86 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>