More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2296 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2296  ferredoxin (2Fe-2S)  100 
 
 		 112 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  63.04 
 
 		 268 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  60.98 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  59.76 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  59.76 
 
 		 99 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  58.33 
 
 		 99 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  60.49 
 
 		 99 aa  100  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  58.54 
 
 		 98 aa  99.4  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  53.61 
 
 		 99 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  58.54 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  59.04 
 
 		 94 aa  99.4  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  58.33 
 
 		 99 aa  99  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  59.04 
 
 		 99 aa  98.2  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  59.04 
 
 		 99 aa  98.2  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  59.04 
 
 		 99 aa  98.2  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  57.14 
 
 		 99 aa  97.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  59.26 
 
 		 99 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  57.65 
 
 		 99 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  59.26 
 
 		 99 aa  95.1  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  62.67 
 
 		 100 aa  93.6  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  57.32 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  63.16 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  47.12 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  53.09 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  51.61 
 
 		 96 aa  86.3  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1567  ferredoxin (2Fe-2S)  49 
 
 		 98 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.703067  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  46.53 
 
 		 104 aa  83.6  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  52.63 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  52.44 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  52.44 
 
 		 99 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  52.56 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  48.84 
 
 		 94 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  45.68 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  40.59 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  42.57 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  50 
 
 		 98 aa  76.6  0.00000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  46.99 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  41.35 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  41.35 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  43.33 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  38.14 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  38.14 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  35.64 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  38 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  37.11 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1874  (2Fe-2S) ferredoxin  38.64 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  35.64 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  35.05 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  40.4 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1089  ferredoxin (2Fe-2S)  46.15 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  45.57 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.2 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  38.55 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  38.55 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  36.73 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  35.05 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1430  ferredoxin  38.82 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0882  ferredoxin  40.51 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0891946  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  31.82 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0320  ferredoxin  50.79 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2779  ferredoxin  38.82 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.643117  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  30.12 
 
 		 319 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1376  ferredoxin  37.65 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3940  ferredoxin (2Fe-2S)  42.71 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4258  ferredoxin (2Fe-2S)  41.67 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  37.35 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  32.65 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0319  ferredoxin  45.59 
 
 		 346 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0329  ferredoxin  45.59 
 
 		 346 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  38.1 
 
 		 366 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  37.31 
 
 		 356 aa  57  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  32.65 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  41.27 
 
 		 350 aa  57  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0414  ferredoxin  34.44 
 
 		 193 aa  57  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  38.46 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0310  oxidoreductase FAD-binding subunit  46.97 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  39.19 
 
 		 681 aa  56.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  38.46 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1591  hypothetical protein  44.29 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  35.23 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.44 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4880  ferredoxin  42.03 
 
 		 350 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.30814 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  44.93 
 
 		 373 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_8944  predicted protein  38.16 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.268011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1059  ferredoxin (2Fe-2S)  40.48 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0545  ferredoxin  46.67 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  33.66 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.5 
 
 		 351 aa  54.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0991  putative ring-hydroxylation complex protein 4  38.67 
 
 		 361 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.153237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1136  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.84 
 
 		 339 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  33.33 
 
 		 368 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  33.33 
 
 		 368 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  33.33 
 
 		 368 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  39.29 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3637  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.54 
 
 		 365 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1615  ferredoxin  37.5 
 
 		 218 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.640152 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0932  ferredoxin  33.33 
 
 		 358 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0814  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.33 
 
 		 365 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.382172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  36.05 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>