More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5112 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5112  ferredoxin  100 
 
 
108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528807  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3824  putative ferredoxin  67.01 
 
 
102 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232359  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0798  iron-sulfur cluster-binding protein  60.24 
 
 
96 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2159  2Fe-2S iron-sulfur  60.24 
 
 
96 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0888  2Fe-2S iron-sulfur  60.24 
 
 
96 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225976  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1820  2Fe-2S iron-sulfur  60.24 
 
 
96 aa  101  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3434  ferredoxin  55.17 
 
 
110 aa  100  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1368  ferredoxin  55.56 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.996751  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0697  ferredoxin  54.22 
 
 
100 aa  94.7  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812143  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4923  ferredoxin  55.42 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4404  ferredoxin  55.42 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5307  ferredoxin  54.22 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.786726  normal  0.0713222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3387  ferredoxin  54.22 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.864897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4980  ferredoxin  54.22 
 
 
100 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786925  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3640  ferredoxin  53.01 
 
 
105 aa  93.6  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533623  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3428  ferredoxin  50.59 
 
 
129 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.883916  normal  0.379266 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1286  ferredoxin  58.82 
 
 
103 aa  92.8  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5660  ferredoxin  53.01 
 
 
103 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.926642 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1074  ferredoxin-(2Fe-2S)-binding protein  52.81 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3652  ferredoxin  49.4 
 
 
93 aa  88.2  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2756  ferredoxin  47.67 
 
 
111 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.108856 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1389  ferredoxin  45.24 
 
 
97 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2234  ferredoxin  53.73 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  hitchhiker  0.000426891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2469  ferredoxin  43.53 
 
 
117 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2255  ferredoxin  60.34 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2765  ferredoxin  60.34 
 
 
97 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174551  normal  0.655324 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2703  ferredoxin  39.29 
 
 
89 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1261  ferredoxin  41.11 
 
 
356 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3559  p-cymene monooxygenase, reductase subunit(CymAb)  40.96 
 
 
349 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393821  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002101  ferredoxin  35.37 
 
 
89 aa  62  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000061516  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1567  putative flavodoxin oxidoreductase  37.78 
 
 
327 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.36 
 
 
357 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.21 
 
 
349 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.21 
 
 
346 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  36.78 
 
 
108 aa  60.5  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.21 
 
 
349 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00333  phenol hydroxylase  34.15 
 
 
89 aa  60.1  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2902  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.55 
 
 
349 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.612031 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0151  putative ferredoxin  34.15 
 
 
87 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0245789  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.47 
 
 
383 aa  58.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.88 
 
 
349 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  41.43 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.56 
 
 
350 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.56 
 
 
350 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4186  ferredoxin  34.52 
 
 
346 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  36.05 
 
 
338 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.05 
 
 
338 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4051  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.58 
 
 
342 aa  55.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548606  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0228  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.71 
 
 
362 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0180747  hitchhiker  0.0014836 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.37 
 
 
342 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  38.46 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.63 
 
 
341 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  32.98 
 
 
104 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3425  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.24 
 
 
362 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0901107  normal  0.882381 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0254  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.24 
 
 
362 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0292434  normal  0.0307686 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3765  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.68 
 
 
332 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.71 
 
 
345 aa  53.5  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  36.25 
 
 
99 aa  53.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  38.16 
 
 
122 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2468  ferredoxin  34.09 
 
 
344 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0245  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.24 
 
 
362 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3115  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  38.24 
 
 
362 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136188  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2577  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  38.24 
 
 
362 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.616553  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3533  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  38.24 
 
 
362 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.05 
 
 
336 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0011  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.24 
 
 
362 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  32.26 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.72 
 
 
360 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1980  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  38.24 
 
 
362 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.144649  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  32.26 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3779  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.24 
 
 
362 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0589683  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2780  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.24 
 
 
362 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0478602  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0008  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.24 
 
 
362 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0203524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0306  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.24 
 
 
362 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.144813  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  34.88 
 
 
342 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3840  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.24 
 
 
362 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0326  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.24 
 
 
362 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  38.16 
 
 
122 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  30.93 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2973  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.15 
 
 
341 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  33.33 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.46 
 
 
351 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  38.03 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1377  ferredoxin  38.1 
 
 
344 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574096  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  38.16 
 
 
122 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.13 
 
 
360 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.05 
 
 
343 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  39.44 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  35.14 
 
 
99 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  35.14 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  42.42 
 
 
121 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  36.9 
 
 
333 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  35.14 
 
 
99 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  34.41 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  35.14 
 
 
99 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  35 
 
 
100 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1380  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.29 
 
 
363 aa  51.6  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.611376  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  36.49 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.33 
 
 
349 aa  51.2  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  31.76 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>