More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1368 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1368  ferredoxin  100 
 
 
108 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.996751  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1820  2Fe-2S iron-sulfur  68.24 
 
 
96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0888  2Fe-2S iron-sulfur  64.52 
 
 
96 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225976  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2159  2Fe-2S iron-sulfur  64.52 
 
 
96 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0798  iron-sulfur cluster-binding protein  64.52 
 
 
96 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5660  ferredoxin  57 
 
 
103 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.926642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3434  ferredoxin  56.84 
 
 
110 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1286  ferredoxin  58.43 
 
 
103 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3428  ferredoxin  58.82 
 
 
129 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.883916  normal  0.379266 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2756  ferredoxin  63.41 
 
 
111 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.108856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1074  ferredoxin-(2Fe-2S)-binding protein  53.47 
 
 
120 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3652  ferredoxin  57.83 
 
 
93 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4923  ferredoxin  59.04 
 
 
100 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0697  ferredoxin  54.95 
 
 
100 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812143  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4404  ferredoxin  59.04 
 
 
100 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3387  ferredoxin  59.04 
 
 
100 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.864897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4980  ferredoxin  59.04 
 
 
100 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786925  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5307  ferredoxin  59.04 
 
 
100 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.786726  normal  0.0713222 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3640  ferredoxin  59.04 
 
 
105 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533623  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3824  putative ferredoxin  59.38 
 
 
102 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232359  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5112  ferredoxin  55.56 
 
 
108 aa  94.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528807  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1389  ferredoxin  48.28 
 
 
97 aa  90.5  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2255  ferredoxin  55.71 
 
 
97 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2765  ferredoxin  55.71 
 
 
97 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174551  normal  0.655324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2469  ferredoxin  43.02 
 
 
117 aa  82.8  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2234  ferredoxin  55.07 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  hitchhiker  0.000426891 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  48.84 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  44.71 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.36 
 
 
350 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.36 
 
 
350 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.18 
 
 
354 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.91 
 
 
357 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1766  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.78 
 
 
350 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.316393  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.3 
 
 
350 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.86 
 
 
345 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.05 
 
 
340 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00333  phenol hydroxylase  36.9 
 
 
89 aa  61.6  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002101  ferredoxin  36.9 
 
 
89 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000061516  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  48.48 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3790  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  47.06 
 
 
346 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0151  putative ferredoxin  35.29 
 
 
87 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0245789  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  37.08 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.29 
 
 
360 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.53 
 
 
348 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2703  ferredoxin  41.67 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163981  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  43.42 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  43.42 
 
 
122 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1380  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.7 
 
 
363 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.611376  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2793  putative reductase component of monooxygenase  37.78 
 
 
365 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  37.08 
 
 
122 aa  57.4  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.66 
 
 
342 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.7 
 
 
349 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1507  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.78 
 
 
365 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  42.05 
 
 
343 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  39.13 
 
 
122 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  43.18 
 
 
333 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  42.35 
 
 
343 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  39.53 
 
 
338 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.53 
 
 
338 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  37.66 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.21 
 
 
348 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2281  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  47.76 
 
 
335 aa  53.9  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.95 
 
 
342 aa  53.9  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.23 
 
 
341 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4192  ferredoxin  31.52 
 
 
98 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  30.59 
 
 
319 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.82 
 
 
343 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3690  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.71 
 
 
468 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2722  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.37 
 
 
354 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3765  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.08 
 
 
332 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.23 
 
 
383 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.21 
 
 
349 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  29.41 
 
 
320 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  42.25 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  42.25 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1656  ferredoxin/oxidoreductase, FAD/NAD-binding  36.17 
 
 
342 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1299  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46.15 
 
 
928 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  43.48 
 
 
99 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  40 
 
 
94 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.65 
 
 
343 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.7 
 
 
352 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.21 
 
 
349 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3715  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.39 
 
 
467 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437326  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  36.99 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.21 
 
 
349 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  42.42 
 
 
99 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  31.76 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3098  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.46 
 
 
336 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  36.84 
 
 
122 aa  50.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  31.76 
 
 
89 aa  50.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1770  putative flavodoxin oxidoreductase  38.3 
 
 
486 aa  50.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0104473  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3306  oxidoreductase FAD-binding subunit  37.21 
 
 
353 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592709  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4185  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40.62 
 
 
752 aa  50.4  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.67 
 
 
669 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  37.33 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1405  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.48 
 
 
881 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  37.35 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  33.33 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  35.53 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  42.11 
 
 
379 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>