More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3434 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3434  ferredoxin  100 
 
 		 110 aa  220  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1286  ferredoxin  68.82 
 
 		 103 aa  124  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1074  ferredoxin-(2Fe-2S)-binding protein  55.88 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0798  iron-sulfur cluster-binding protein  65.43 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2159  2Fe-2S iron-sulfur  65.43 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1820  2Fe-2S iron-sulfur  63.53 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0888  2Fe-2S iron-sulfur  65.43 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225976  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5660  ferredoxin  61.18 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.926642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3652  ferredoxin  58.33 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1368  ferredoxin  56.84 
 
 		 108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3428  ferredoxin  55.17 
 
 		 129 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.883916  normal  0.379266 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4923  ferredoxin  59.26 
 
 		 100 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4404  ferredoxin  59.26 
 
 		 100 aa  103  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0697  ferredoxin  58.02 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3640  ferredoxin  58.02 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5307  ferredoxin  58.02 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.786726  normal  0.0713222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3387  ferredoxin  58.02 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.864897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4980  ferredoxin  58.02 
 
 		 100 aa  101  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5112  ferredoxin  55.17 
 
 		 108 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528807  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1389  ferredoxin  51.76 
 
 		 97 aa  97.8  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3824  putative ferredoxin  61.8 
 
 		 102 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2765  ferredoxin  53.12 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174551  normal  0.655324 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2255  ferredoxin  53.12 
 
 		 97 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2469  ferredoxin  46.6 
 
 		 117 aa  93.6  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2234  ferredoxin  52.94 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  hitchhiker  0.000426891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2756  ferredoxin  57.53 
 
 		 111 aa  90.9  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.108856 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.66 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.66 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  47.83 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  43.53 
 
 		 338 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.53 
 
 		 338 aa  65.1  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.18 
 
 		 356 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.18 
 
 		 363 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  40.26 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  34.38 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  37.5 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  37.5 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  38.04 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.78 
 
 		 383 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  38.04 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  37.5 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  41.03 
 
 		 616 aa  60.1  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  42.47 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  43.84 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  36.36 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  38.96 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  35.23 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  41.67 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  41.67 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  43.06 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  43.84 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  46.58 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1828  putative CDP-6-deoxy-delta-3,4- glucoseen reductase  42.7 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.63 
 
 		 351 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  34.38 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  34.09 
 
 		 320 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00333  phenol hydroxylase  32.14 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  41.1 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  40.54 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  39.73 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  39.73 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  39.73 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  48.39 
 
 		 669 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.27 
 
 		 357 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  42.42 
 
 		 605 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14011  hypothetical protein  36.17 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.908602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0599  ferredoxin  36.17 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002101  ferredoxin  32.14 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000061516  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.47 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4192  ferredoxin  40.3 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4353  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.5 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  35.71 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  39.73 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  39.73 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  39.73 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  35.71 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  39.73 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.14 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  44.62 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0575  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.29 
 
 		 321 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.98 
 
 		 349 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  44.62 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40 
 
 		 357 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1220  ferredoxin  40.91 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.399745  decreased coverage  0.00184226 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  40.79 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  29.89 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  41.1 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1766  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.04 
 
 		 350 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.316393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2703  ferredoxin  34.52 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  34.48 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1380  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.59 
 
 		 363 aa  54.3  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.611376  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  43.08 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3765  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.78 
 
 		 332 aa  53.9  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.27 
 
 		 345 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  37.97 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40 
 
 		 342 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  35.63 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  35.63 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.71 
 
 		 585 aa  53.9  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>