More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1220 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1220  ferredoxin  100 
 
 		 321 aa  635    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.399745  decreased coverage  0.00184226 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  42.9 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  42.9 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  42.27 
 
 		 322 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  44.27 
 
 		 351 aa  245  9e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  45.15 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  45.72 
 
 		 323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  38.7 
 
 		 319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  36.36 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  40.19 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  39.57 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  39.06 
 
 		 323 aa  186  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  41.8 
 
 		 327 aa  185  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  36.73 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  42.37 
 
 		 331 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5138  ferredoxin  39.87 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  40.25 
 
 		 322 aa  177  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  38.41 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  38.41 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  41.49 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  36.42 
 
 		 331 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  40.85 
 
 		 784 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  37.04 
 
 		 320 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.32 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  36.89 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  36.25 
 
 		 332 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  39.26 
 
 		 324 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2298  ferredoxin  40.13 
 
 		 315 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  37.19 
 
 		 325 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2259  ferredoxin  40.13 
 
 		 315 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379114  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2306  ferredoxin  40.13 
 
 		 315 aa  172  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40796  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  36.56 
 
 		 321 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  37.11 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  36.25 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  38.41 
 
 		 769 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  34.53 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  35.98 
 
 		 321 aa  169  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  37.35 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  37.35 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  39.61 
 
 		 321 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  36.25 
 
 		 321 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  36.25 
 
 		 321 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  39.62 
 
 		 774 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  36.39 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  38.76 
 
 		 333 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  36.25 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  36.25 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  36.25 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  36.08 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  40.44 
 
 		 784 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.73 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  40.44 
 
 		 784 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  40.44 
 
 		 784 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  40.44 
 
 		 784 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  35.76 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  40.13 
 
 		 784 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  40.13 
 
 		 784 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  37.38 
 
 		 321 aa  165  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.42 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  36.45 
 
 		 315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  39.81 
 
 		 784 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  36.84 
 
 		 317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.31 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  35.65 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  36.22 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  38.14 
 
 		 317 aa  163  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  36.78 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  36.67 
 
 		 318 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3608  ferredoxin  37.65 
 
 		 317 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  37.42 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  34.49 
 
 		 316 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  38.73 
 
 		 783 aa  162  9e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  35.87 
 
 		 319 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  35.94 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  38.01 
 
 		 782 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  37.46 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  36.49 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  38.41 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  35.67 
 
 		 780 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  37.46 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  36.2 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  37.25 
 
 		 788 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  29.79 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2193  ferredoxin  35.26 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0744529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.62 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  39.42 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  37.38 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3141  ferredoxin  38.39 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3180  ferredoxin  41.3 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  35.76 
 
 		 337 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.46 
 
 		 783 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  30.65 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  35.83 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.09 
 
 		 317 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4832  ferredoxin  38.92 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000030603  hitchhiker  0.00755842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  34.06 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  36.77 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  36.3 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  36.33 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  32.92 
 
 		 588 aa  157  3e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>