More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3428 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3428  ferredoxin  100 
 
 
129 aa  263  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.883916  normal  0.379266 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1820  2Fe-2S iron-sulfur  76.34 
 
 
96 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5660  ferredoxin  73.63 
 
 
103 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.926642 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1074  ferredoxin-(2Fe-2S)-binding protein  63.96 
 
 
120 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2159  2Fe-2S iron-sulfur  75.27 
 
 
96 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0888  2Fe-2S iron-sulfur  75.27 
 
 
96 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225976  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0798  iron-sulfur cluster-binding protein  75.27 
 
 
96 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3640  ferredoxin  68 
 
 
105 aa  147  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533623  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0697  ferredoxin  75.86 
 
 
100 aa  144  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812143  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4980  ferredoxin  75.86 
 
 
100 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786925  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3387  ferredoxin  75.86 
 
 
100 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.864897  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5307  ferredoxin  75.86 
 
 
100 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.786726  normal  0.0713222 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4923  ferredoxin  72.22 
 
 
100 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4404  ferredoxin  74.71 
 
 
100 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3652  ferredoxin  57.78 
 
 
93 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3434  ferredoxin  55.17 
 
 
110 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1368  ferredoxin  58.82 
 
 
108 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.996751  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1286  ferredoxin  53.54 
 
 
103 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5112  ferredoxin  50.59 
 
 
108 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528807  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2756  ferredoxin  46.81 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.108856 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3824  putative ferredoxin  53.19 
 
 
102 aa  87.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232359  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1389  ferredoxin  47.62 
 
 
97 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2469  ferredoxin  38.32 
 
 
117 aa  84  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2234  ferredoxin  44.19 
 
 
99 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  hitchhiker  0.000426891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2255  ferredoxin  50 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2765  ferredoxin  50 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174551  normal  0.655324 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2703  ferredoxin  43.53 
 
 
89 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163981  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.32 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  44.32 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.83 
 
 
336 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.19 
 
 
346 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  40.21 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1507  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.36 
 
 
365 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002101  ferredoxin  37.65 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000061516  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.82 
 
 
354 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2793  putative reductase component of monooxygenase  36.36 
 
 
365 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00333  phenol hydroxylase  36.47 
 
 
89 aa  63.9  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.77 
 
 
340 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.77 
 
 
383 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3765  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.18 
 
 
332 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2708  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.82 
 
 
337 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2966  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  39.33 
 
 
337 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3163  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.82 
 
 
336 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141012  normal  0.450185 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1380  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.14 
 
 
363 aa  61.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.611376  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2552  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.82 
 
 
336 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.14 
 
 
353 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2686  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.82 
 
 
336 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.831402  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.71 
 
 
343 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2323  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  41.38 
 
 
335 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3306  oxidoreductase FAD-binding subunit  38 
 
 
353 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592709  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3052  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.9 
 
 
329 aa  60.1  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  37.76 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  38.38 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3358  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.19 
 
 
354 aa  60.1  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.98 
 
 
350 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.05 
 
 
360 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  36.73 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2896  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.9 
 
 
329 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00679398  normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  38.38 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.9 
 
 
329 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.158036  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.38 
 
 
350 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.29 
 
 
354 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5822  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.63 
 
 
343 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.92832  normal  0.0803192 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.29 
 
 
354 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2515  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.63 
 
 
343 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2408  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.63 
 
 
343 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.233033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.38 
 
 
350 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30710  Multi-component phenol hydoxylase, reductase subunit; LapP  34.29 
 
 
353 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431626  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1879  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.63 
 
 
343 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  40.74 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2490  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.63 
 
 
343 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2537  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.63 
 
 
343 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753859  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5685  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  34.31 
 
 
354 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  44 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  38.27 
 
 
99 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1593  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.71 
 
 
340 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324243  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7048  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  45.71 
 
 
340 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268276 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3240  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.25 
 
 
342 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1828  putative CDP-6-deoxy-delta-3,4- glucoseen reductase  35.35 
 
 
341 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6582  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  45.71 
 
 
341 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10458  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0599  ferredoxin  37.8 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2722  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.27 
 
 
354 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4192  ferredoxin  38.57 
 
 
98 aa  57  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2791  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.24 
 
 
354 aa  57  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14011  hypothetical protein  37.8 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.908602  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.58 
 
 
375 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1366  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.29 
 
 
342 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0161467  normal  0.193638 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1430  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.29 
 
 
342 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0543245  normal  0.324451 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  35.96 
 
 
100 aa  57  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  35.29 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  35.29 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  38.2 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.05 
 
 
585 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3111  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.33 
 
 
351 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461281  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  43.04 
 
 
344 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.29 
 
 
341 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.65 
 
 
349 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.78 
 
 
341 aa  55.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6133  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  44.29 
 
 
340 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1766  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.31 
 
 
350 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.316393  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>