More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2756 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2756  ferredoxin  100 
 
 		 111 aa  218  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.108856 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3652  ferredoxin  60.98 
 
 		 93 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1368  ferredoxin  63.41 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4923  ferredoxin  54.26 
 
 		 100 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1074  ferredoxin-(2Fe-2S)-binding protein  53.85 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4404  ferredoxin  54.55 
 
 		 100 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0697  ferredoxin  55.17 
 
 		 100 aa  95.9  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5307  ferredoxin  55.17 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.786726  normal  0.0713222 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4980  ferredoxin  55.17 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3387  ferredoxin  55.17 
 
 		 100 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.864897  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3640  ferredoxin  55.17 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5660  ferredoxin  51.65 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.926642 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2159  2Fe-2S iron-sulfur  58.23 
 
 		 96 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1820  2Fe-2S iron-sulfur  58.23 
 
 		 96 aa  94.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0888  2Fe-2S iron-sulfur  58.23 
 
 		 96 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225976  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0798  iron-sulfur cluster-binding protein  58.23 
 
 		 96 aa  94.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3428  ferredoxin  46.81 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.883916  normal  0.379266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1389  ferredoxin  56.79 
 
 		 97 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2234  ferredoxin  48.48 
 
 		 99 aa  90.9  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  hitchhiker  0.000426891 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3434  ferredoxin  57.53 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2469  ferredoxin  46 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1286  ferredoxin  57.14 
 
 		 103 aa  84.3  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2255  ferredoxin  48.78 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2765  ferredoxin  48.78 
 
 		 97 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174551  normal  0.655324 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3824  putative ferredoxin  54.55 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5112  ferredoxin  47.67 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528807  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  39.58 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  38.46 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.18 
 
 		 383 aa  65.5  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2886  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase  43.59 
 
 		 366 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00113682  decreased coverage  0.000127414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  38.2 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00333  phenol hydroxylase  36.9 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  40.74 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  42.35 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  37.36 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  44.3 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1724  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.47 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1828  putative CDP-6-deoxy-delta-3,4- glucoseen reductase  41.76 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.78 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  44.3 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  34.41 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  38.46 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  34.07 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  39.36 
 
 		 379 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2703  ferredoxin  37.21 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163981  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  40.51 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  42.5 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1442  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.68 
 
 		 348 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.995391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  41.77 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002101  ferredoxin  35.71 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000061516  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  36.26 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  35.71 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  34.02 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  34.02 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  41.77 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  35.16 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3426  ferredoxin  41.18 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.13 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.65 
 
 		 345 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4192  ferredoxin  30.12 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  39.76 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  35.16 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  34.52 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  39.47 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  40.24 
 
 		 605 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  40.7 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.63 
 
 		 342 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  34.74 
 
 		 342 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  43.75 
 
 		 585 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.45 
 
 		 343 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2143  ferredoxin  39.47 
 
 		 344 aa  54.3  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000191342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  35.44 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.36 
 
 		 360 aa  54.3  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3785  ferredoxin  48.21 
 
 		 339 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870039  normal  0.280135 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3712  ferredoxin  48.21 
 
 		 339 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.709133  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  35.29 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  35.37 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  33.33 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  33.33 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3725  ferredoxin  48.21 
 
 		 339 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  33.33 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  32.94 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  32.94 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  32.94 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  35.53 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  32.94 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2973  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.33 
 
 		 341 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0151  putative ferredoxin  32.14 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0245789  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  40.51 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.82 
 
 		 342 aa  53.9  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  31.25 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  31.25 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  42.65 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.62 
 
 		 669 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4353  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.9 
 
 		 331 aa  53.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40 
 
 		 356 aa  53.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  35.53 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  39.24 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0381  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.75 
 
 		 365 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.155408  hitchhiker  0.00902786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.12 
 
 		 341 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>