More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3640 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3640  ferredoxin  100 
 
 
105 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4404  ferredoxin  92.93 
 
 
100 aa  187  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5307  ferredoxin  92.93 
 
 
100 aa  186  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.786726  normal  0.0713222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3387  ferredoxin  92.93 
 
 
100 aa  186  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.864897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4980  ferredoxin  92.93 
 
 
100 aa  186  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786925  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4923  ferredoxin  91.92 
 
 
100 aa  184  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0697  ferredoxin  91.92 
 
 
100 aa  183  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812143  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5660  ferredoxin  73.96 
 
 
103 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.926642 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1074  ferredoxin-(2Fe-2S)-binding protein  73.96 
 
 
120 aa  156  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3428  ferredoxin  68 
 
 
129 aa  147  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.883916  normal  0.379266 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1820  2Fe-2S iron-sulfur  72.92 
 
 
96 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0798  iron-sulfur cluster-binding protein  71.88 
 
 
96 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2159  2Fe-2S iron-sulfur  71.88 
 
 
96 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0888  2Fe-2S iron-sulfur  71.88 
 
 
96 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225976  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3652  ferredoxin  59.77 
 
 
93 aa  116  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3434  ferredoxin  58.02 
 
 
110 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1368  ferredoxin  59.04 
 
 
108 aa  96.3  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.996751  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2756  ferredoxin  55.17 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.108856 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1286  ferredoxin  60.98 
 
 
103 aa  94  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5112  ferredoxin  53.01 
 
 
108 aa  93.6  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528807  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1389  ferredoxin  49.46 
 
 
97 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2469  ferredoxin  51.19 
 
 
117 aa  90.9  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2234  ferredoxin  51.76 
 
 
99 aa  90.5  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  hitchhiker  0.000426891 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3824  putative ferredoxin  60.71 
 
 
102 aa  89.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232359  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2255  ferredoxin  46.43 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2765  ferredoxin  46.43 
 
 
97 aa  78.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174551  normal  0.655324 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  43.53 
 
 
340 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2703  ferredoxin  40.7 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163981  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00333  phenol hydroxylase  35.37 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002101  ferredoxin  35.37 
 
 
89 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000061516  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  44.71 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  44.71 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.67 
 
 
346 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  40 
 
 
342 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.86 
 
 
383 aa  63.5  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  42.35 
 
 
345 aa  63.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.48 
 
 
350 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.48 
 
 
350 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  42.35 
 
 
338 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  42.35 
 
 
338 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  46.38 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  42.86 
 
 
122 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  40.91 
 
 
122 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.43 
 
 
354 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.43 
 
 
354 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.04 
 
 
336 aa  60.8  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  39.77 
 
 
122 aa  60.1  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0151  putative ferredoxin  35.9 
 
 
87 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0245789  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1380  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.63 
 
 
363 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.611376  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0711  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  39.51 
 
 
329 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.08 
 
 
333 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3765  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  46.97 
 
 
332 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.1 
 
 
360 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2722  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.9 
 
 
354 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5685  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.42 
 
 
354 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2793  putative reductase component of monooxygenase  35.63 
 
 
365 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1507  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.63 
 
 
365 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1828  putative CDP-6-deoxy-delta-3,4- glucoseen reductase  37.35 
 
 
341 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  41.03 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4353  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40 
 
 
331 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4192  ferredoxin  36.49 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  44.59 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.29 
 
 
357 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.9 
 
 
350 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  42.68 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.1 
 
 
354 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  41.1 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.9 
 
 
329 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.158036  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3052  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.9 
 
 
329 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2896  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.9 
 
 
329 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00679398  normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1766  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.78 
 
 
350 aa  55.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.316393  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  37.8 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  36.25 
 
 
99 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  39.29 
 
 
342 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  37.97 
 
 
100 aa  55.1  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  34.94 
 
 
89 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  34.94 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  35.37 
 
 
99 aa  55.1  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.18 
 
 
342 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.1 
 
 
669 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.29 
 
 
351 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3306  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.9 
 
 
353 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592709  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0599  ferredoxin  40 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2861  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.52 
 
 
351 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.771556  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.12 
 
 
349 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2886  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase  38.96 
 
 
366 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00113682  decreased coverage  0.000127414 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  39.39 
 
 
366 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1261  ferredoxin  39.29 
 
 
356 aa  53.9  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14011  hypothetical protein  40 
 
 
104 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.908602  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.12 
 
 
349 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  35.44 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.7 
 
 
343 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.79 
 
 
585 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  35.44 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  35.44 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.9 
 
 
349 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.7 
 
 
343 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.12 
 
 
349 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.08 
 
 
343 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  35.44 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>