More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1389 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1389  ferredoxin  100 
 
 		 97 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2469  ferredoxin  70.97 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2255  ferredoxin  72.41 
 
 		 97 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2765  ferredoxin  72.41 
 
 		 97 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174551  normal  0.655324 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2234  ferredoxin  71.59 
 
 		 99 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  hitchhiker  0.000426891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3652  ferredoxin  65.38 
 
 		 93 aa  103  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1286  ferredoxin  55.06 
 
 		 103 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3434  ferredoxin  51.76 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1074  ferredoxin-(2Fe-2S)-binding protein  51.61 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0697  ferredoxin  50 
 
 		 100 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3640  ferredoxin  49.46 
 
 		 105 aa  93.2  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5307  ferredoxin  49.46 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.786726  normal  0.0713222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3387  ferredoxin  49.46 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.864897  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5660  ferredoxin  50.54 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.926642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4980  ferredoxin  49.46 
 
 		 100 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2756  ferredoxin  56.79 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.108856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4404  ferredoxin  48.39 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4923  ferredoxin  48.39 
 
 		 100 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1368  ferredoxin  48.28 
 
 		 108 aa  90.5  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2159  2Fe-2S iron-sulfur  56.25 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1820  2Fe-2S iron-sulfur  56.25 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0888  2Fe-2S iron-sulfur  56.25 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225976  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0798  iron-sulfur cluster-binding protein  56.25 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3824  putative ferredoxin  51.19 
 
 		 102 aa  87.4  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3428  ferredoxin  47.62 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.883916  normal  0.379266 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5112  ferredoxin  45.24 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528807  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  40.74 
 
 		 338 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.74 
 
 		 338 aa  64.3  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  37.93 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  37.66 
 
 		 100 aa  62  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  36.47 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  44.93 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  40.54 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  40.28 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  35 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  37.84 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  35.56 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  40.54 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.16 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  43.94 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.37 
 
 		 345 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.16 
 
 		 350 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  35.37 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4539  ferredoxin (2Fe-2S)  31.63 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.250574 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  37.18 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.36 
 
 		 383 aa  58.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.59 
 
 		 349 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  39.47 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  32.97 
 
 		 98 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  39.47 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  42.42 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  39.24 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  44.26 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  42.03 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  42.03 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.29 
 
 		 346 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.59 
 
 		 349 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  39.71 
 
 		 99 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  39.47 
 
 		 109 aa  57  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  41.18 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.59 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  39.71 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  39.13 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.12 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  39.13 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  41.18 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  39.13 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  39.71 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2703  ferredoxin  33.33 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163981  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  39.71 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  40.58 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.61 
 
 		 585 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  35.06 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  36.84 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  43.48 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  32.94 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  35.06 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.12 
 
 		 343 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.51 
 
 		 333 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  37.5 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.94 
 
 		 341 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2886  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase  37.65 
 
 		 366 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00113682  decreased coverage  0.000127414 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  32.47 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  34.15 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.37 
 
 		 349 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.94 
 
 		 343 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  43.94 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  35.14 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  43.48 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.65 
 
 		 342 aa  54.7  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  43.48 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2143  ferredoxin  38.89 
 
 		 344 aa  54.3  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000191342  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0599  ferredoxin  40 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.94 
 
 		 343 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14011  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.908602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  36.49 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.04 
 
 		 342 aa  53.5  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0414  ferredoxin  30.34 
 
 		 193 aa  53.5  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 		 681 aa  53.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>