More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2469 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2469  ferredoxin  100 
 
 		 117 aa  240  5e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1389  ferredoxin  70.97 
 
 		 97 aa  142  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2234  ferredoxin  71.59 
 
 		 99 aa  140  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  hitchhiker  0.000426891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2765  ferredoxin  69.79 
 
 		 97 aa  140  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174551  normal  0.655324 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2255  ferredoxin  69.79 
 
 		 97 aa  140  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3652  ferredoxin  58.33 
 
 		 93 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1286  ferredoxin  53.93 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3434  ferredoxin  46.6 
 
 		 110 aa  93.6  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4923  ferredoxin  49.47 
 
 		 100 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4404  ferredoxin  49.47 
 
 		 100 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0697  ferredoxin  49.44 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1074  ferredoxin-(2Fe-2S)-binding protein  44.55 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3640  ferredoxin  51.19 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5307  ferredoxin  48.42 
 
 		 100 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.786726  normal  0.0713222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3387  ferredoxin  48.42 
 
 		 100 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.864897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4980  ferredoxin  48.42 
 
 		 100 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2159  2Fe-2S iron-sulfur  51.19 
 
 		 96 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1820  2Fe-2S iron-sulfur  51.19 
 
 		 96 aa  87.8  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5660  ferredoxin  45.88 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.926642 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0888  2Fe-2S iron-sulfur  51.19 
 
 		 96 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225976  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2756  ferredoxin  46 
 
 		 111 aa  87.8  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.108856 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0798  iron-sulfur cluster-binding protein  51.19 
 
 		 96 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3428  ferredoxin  38.32 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.883916  normal  0.379266 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1368  ferredoxin  43.02 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3824  putative ferredoxin  47.73 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5112  ferredoxin  43.53 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528807  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  38.1 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  39.19 
 
 		 99 aa  62  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  39.19 
 
 		 99 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  39.19 
 
 		 99 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  43.94 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.74 
 
 		 383 aa  60.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  37.65 
 
 		 89 aa  60.1  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  36.9 
 
 		 606 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  42.42 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  40.54 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  33.66 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  36.9 
 
 		 606 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  40.58 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  40.58 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  34.88 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  32.61 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  35.56 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  34.88 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  41.18 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  41.18 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  41.18 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  37.08 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3426  ferredoxin  39.29 
 
 		 351 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  39.71 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  39.13 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  41.77 
 
 		 605 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  37.68 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  40.58 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  34.91 
 
 		 605 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  33.33 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  36.49 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.35 
 
 		 585 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3180  ferredoxin  39.47 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.21 
 
 		 350 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  36 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.21 
 
 		 350 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  39.13 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  36.23 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.63 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  31.46 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2886  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase  31.58 
 
 		 366 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00113682  decreased coverage  0.000127414 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  31.08 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  36.23 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  33.77 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  36.23 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  31.08 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  33.72 
 
 		 342 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1261  ferredoxin  36.05 
 
 		 356 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.56 
 
 		 336 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.9 
 
 		 382 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  37.68 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.58 
 
 		 363 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  39.13 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  37.68 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  39.13 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09840  ferredoxin  33.71 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260552  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.72 
 
 		 342 aa  53.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1220  ferredoxin  38.64 
 
 		 321 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.399745  decreased coverage  0.00184226 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  35.23 
 
 		 382 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  36.36 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 		 681 aa  53.5  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.13 
 
 		 702 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  38.89 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2703  ferredoxin  33.33 
 
 		 89 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163981  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  36.36 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  31.58 
 
 		 104 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.68 
 
 		 356 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0491  ferredoxin (2Fe-2S)  31.18 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.963567  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  29.21 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  36.23 
 
 		 99 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  32.43 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  37.68 
 
 		 268 aa  52  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.4 
 
 		 346 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1828  putative CDP-6-deoxy-delta-3,4- glucoseen reductase  34.12 
 
 		 341 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.125347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>