242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1286 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1286  ferredoxin  100 
 
 		 103 aa  203  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3434  ferredoxin  68.82 
 
 		 110 aa  124  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1368  ferredoxin  58.43 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1074  ferredoxin-(2Fe-2S)-binding protein  63.1 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3428  ferredoxin  53.54 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.883916  normal  0.379266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2469  ferredoxin  53.93 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2159  2Fe-2S iron-sulfur  61.9 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0798  iron-sulfur cluster-binding protein  61.9 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0888  2Fe-2S iron-sulfur  61.9 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225976  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1820  2Fe-2S iron-sulfur  61.9 
 
 		 96 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1389  ferredoxin  55.06 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5660  ferredoxin  60.98 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.926642 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2765  ferredoxin  54.55 
 
 		 97 aa  95.9  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174551  normal  0.655324 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2255  ferredoxin  54.55 
 
 		 97 aa  95.9  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4923  ferredoxin  62.2 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4404  ferredoxin  62.2 
 
 		 100 aa  94.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0697  ferredoxin  60.98 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3640  ferredoxin  60.98 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5307  ferredoxin  60.98 
 
 		 100 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.786726  normal  0.0713222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3387  ferredoxin  60.98 
 
 		 100 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.864897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4980  ferredoxin  60.98 
 
 		 100 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3652  ferredoxin  57.32 
 
 		 93 aa  93.6  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5112  ferredoxin  58.82 
 
 		 108 aa  92.8  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528807  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2234  ferredoxin  51.02 
 
 		 99 aa  90.5  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  hitchhiker  0.000426891 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3824  putative ferredoxin  60 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2756  ferredoxin  57.14 
 
 		 111 aa  84.3  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.108856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.95 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.95 
 
 		 350 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  39 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  38.89 
 
 		 605 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  39.53 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  44.71 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  36.59 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  38.2 
 
 		 338 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.2 
 
 		 338 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  34.78 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  41.56 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.56 
 
 		 357 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  37.8 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  42.42 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  39.51 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.21 
 
 		 346 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.05 
 
 		 341 aa  50.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  40.26 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  40.26 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  40.26 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4176  ferredoxin  44.16 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.19775  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  39.29 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  39.29 
 
 		 122 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  38.96 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  36.46 
 
 		 382 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  35.56 
 
 		 605 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.64 
 
 		 340 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.68 
 
 		 360 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  38.96 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  41.89 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.77 
 
 		 342 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  39.74 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0416  putative ferredoxin  39.51 
 
 		 390 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1220  ferredoxin  42.17 
 
 		 321 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.399745  decreased coverage  0.00184226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.05 
 
 		 343 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.71 
 
 		 702 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00333  phenol hydroxylase  36.54 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002101  ferredoxin  36.54 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000061516  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.05 
 
 		 354 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  32.22 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  42.86 
 
 		 99 aa  48.9  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1828  putative CDP-6-deoxy-delta-3,4- glucoseen reductase  37.36 
 
 		 341 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.33 
 
 		 350 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.3 
 
 		 585 aa  48.5  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0217  ferredoxin  33.33 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1766  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.74 
 
 		 350 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.316393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1770  putative flavodoxin oxidoreductase  38.55 
 
 		 486 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0104473  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  37.84 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  35.87 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  30.68 
 
 		 320 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1380  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.78 
 
 		 363 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.611376  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  37.08 
 
 		 616 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.37 
 
 		 336 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2886  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase  36.84 
 
 		 366 aa  47.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00113682  decreased coverage  0.000127414 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  47.14 
 
 		 711 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4353  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.18 
 
 		 331 aa  47  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3765  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  44.29 
 
 		 332 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  41.1 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  38.46 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  38.96 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  30.85 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  30.85 
 
 		 105 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  38.46 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  31.91 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  39.73 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1008  ferredoxin (2Fe-2S)  35.29 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  39.73 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  42.31 
 
 		 268 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  42.42 
 
 		 366 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.23 
 
 		 349 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  40.24 
 
 		 333 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1261  ferredoxin  38.82 
 
 		 356 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.78 
 
 		 382 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  36.59 
 
 		 622 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>