More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2173 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  100 
 
 		 320 aa  662    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  69.47 
 
 		 319 aa  461  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  45.48 
 
 		 321 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  43.93 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  43.93 
 
 		 321 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  43.3 
 
 		 321 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  43.93 
 
 		 321 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  45.34 
 
 		 322 aa  276  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  44.86 
 
 		 321 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  44.55 
 
 		 321 aa  271  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  45.25 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  44.24 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  44.27 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  44.59 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  44.03 
 
 		 316 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  43.81 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  44.13 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  42.54 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  42.99 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  42.04 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  43.81 
 
 		 316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  43.31 
 
 		 316 aa  252  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  40.44 
 
 		 320 aa  249  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  40.81 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  41.72 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  40.45 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.76 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  40 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  39.42 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  37.58 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  41.4 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  38.01 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  37.66 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  42.01 
 
 		 317 aa  216  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.02 
 
 		 315 aa  215  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  37.38 
 
 		 319 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  38.32 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  38.89 
 
 		 320 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  38.7 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  38.39 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2150  ferredoxin  37.73 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  38.2 
 
 		 588 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  37.3 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  41.05 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2111  ferredoxin-oxidoreductase FAD/NAD(P)- binding, ring hydroxylating dioxygenase reductase subunit  38.46 
 
 		 325 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  37.66 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  37.07 
 
 		 334 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  37.01 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  35.76 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  35.44 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  39.46 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  37.66 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  37.66 
 
 		 316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1752  oxidoreductase  35.53 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000180781 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  35.19 
 
 		 321 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  36.91 
 
 		 788 aa  199  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1517  oxidoreductase  35.53 
 
 		 321 aa  198  9e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.46 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  34.12 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.08 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  37.38 
 
 		 324 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  35.69 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  35.91 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  34.56 
 
 		 352 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  35.14 
 
 		 326 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.08 
 
 		 318 aa  192  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  34.83 
 
 		 326 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3566  ferredoxin  35.6 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  36.48 
 
 		 788 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  36.62 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  35.14 
 
 		 784 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5676  ferredoxin  36.92 
 
 		 323 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0301762  normal  0.0416479 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  36.53 
 
 		 321 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  34.62 
 
 		 322 aa  189  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  36.48 
 
 		 318 aa  189  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5899  ferredoxin  36.92 
 
 		 323 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.985129  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  36.93 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  35.03 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  35.03 
 
 		 320 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  35.56 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  35.92 
 
 		 330 aa  185  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  37.01 
 
 		 784 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  36.6 
 
 		 321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  36.27 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  36.69 
 
 		 784 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  36.27 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  36.27 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  36.69 
 
 		 784 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  36.36 
 
 		 784 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  36.36 
 
 		 784 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  36.36 
 
 		 784 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  36.27 
 
 		 321 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  35.95 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  36.36 
 
 		 784 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  31.91 
 
 		 1069 aa  183  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  36.19 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  34.32 
 
 		 321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  34.88 
 
 		 344 aa  182  6e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  34.06 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  35.76 
 
 		 309 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>