More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5830 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  100 
 
 		 317 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  51.57 
 
 		 321 aa  317  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  50.32 
 
 		 321 aa  308  8e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  50.32 
 
 		 321 aa  308  8e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  50.32 
 
 		 321 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  50 
 
 		 321 aa  306  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  50.32 
 
 		 321 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  50.32 
 
 		 321 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  50 
 
 		 321 aa  305  6e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  50 
 
 		 321 aa  305  6e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  49.37 
 
 		 321 aa  302  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2193  ferredoxin  50.47 
 
 		 323 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0744529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1517  oxidoreductase  45.86 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  45.86 
 
 		 321 aa  275  8e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1752  oxidoreductase  45.86 
 
 		 316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000180781 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0171  ferredoxin  45.77 
 
 		 316 aa  268  7e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  46.37 
 
 		 317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3181  ferredoxin  43.71 
 
 		 318 aa  265  5e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0458671 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3608  ferredoxin  43.4 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6582  ferredoxin  42.27 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71028  normal  0.0286768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3313  ferredoxin  42.9 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.64 
 
 		 321 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  42.19 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  42.59 
 
 		 309 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  42.37 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  40.82 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  41.19 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  41.93 
 
 		 321 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  40.5 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  41.32 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  41.01 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  43.71 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  41.38 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  40.57 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  40.57 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  40.31 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  40.31 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  42.81 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  41.82 
 
 		 323 aa  232  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4341  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.78 
 
 		 313 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  39.44 
 
 		 321 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  41.96 
 
 		 317 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  39.13 
 
 		 321 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  39.81 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  42.35 
 
 		 326 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  40.25 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  41.07 
 
 		 588 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  40 
 
 		 316 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  40.33 
 
 		 316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  40.33 
 
 		 316 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.3 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.43 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.75 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  38.77 
 
 		 322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.69 
 
 		 316 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.62 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  38.69 
 
 		 316 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  39.94 
 
 		 334 aa  218  8.999999999999998e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.12 
 
 		 315 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  39.5 
 
 		 319 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  39.17 
 
 		 320 aa  216  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.43 
 
 		 317 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3584  phthalate 4,5-dioxygenase  43.46 
 
 		 318 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.38 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  41.67 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  41.56 
 
 		 351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  40.99 
 
 		 325 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  35.42 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  38.7 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  41.74 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  38.2 
 
 		 332 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  35.49 
 
 		 319 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  37.42 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  38.77 
 
 		 330 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  40.89 
 
 		 774 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  39.68 
 
 		 784 aa  206  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  37.07 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  39.43 
 
 		 788 aa  206  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4812  ferredoxin  38.39 
 
 		 337 aa  205  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  37.46 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2680  ferredoxin  38.23 
 
 		 328 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  40.56 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  40.62 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  38.04 
 
 		 330 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  37.46 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.5 
 
 		 319 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  38.51 
 
 		 327 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  37.54 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  38.56 
 
 		 318 aa  202  6e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  39.13 
 
 		 320 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  39.13 
 
 		 320 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  36.62 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  39.32 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  37.74 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  40.18 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  41.44 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  39.24 
 
 		 782 aa  199  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  38.24 
 
 		 318 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3159  ferredoxin  36.65 
 
 		 322 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  36.31 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>