More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6765 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  100 
 
 
323 aa  659    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  64.35 
 
 
321 aa  418  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  64.35 
 
 
322 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  63.01 
 
 
322 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  59.75 
 
 
323 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  56.04 
 
 
322 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  59.94 
 
 
321 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  58.99 
 
 
321 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  59.31 
 
 
321 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  58.99 
 
 
321 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  57.91 
 
 
321 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  57.69 
 
 
316 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  57.37 
 
 
316 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  57.69 
 
 
316 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  55.06 
 
 
316 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  57.05 
 
 
316 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  57.55 
 
 
320 aa  358  5e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  58.04 
 
 
321 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  54.43 
 
 
316 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  56.01 
 
 
325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  52.34 
 
 
332 aa  328  8e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  54.57 
 
 
315 aa  326  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  51.58 
 
 
319 aa  322  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  51.9 
 
 
317 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  50.63 
 
 
320 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  49.37 
 
 
315 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  48.1 
 
 
319 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  47.48 
 
 
323 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  47.73 
 
 
318 aa  296  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  50.63 
 
 
319 aa  295  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  46.84 
 
 
320 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  47.78 
 
 
317 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  51.27 
 
 
317 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  48.61 
 
 
324 aa  287  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  48.1 
 
 
317 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  46.54 
 
 
331 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  46.2 
 
 
334 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  47.91 
 
 
317 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  42.86 
 
 
330 aa  279  4e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  42.22 
 
 
318 aa  279  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  46.06 
 
 
318 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  48.57 
 
 
321 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  46.37 
 
 
326 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  47.02 
 
 
325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  45.66 
 
 
344 aa  265  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  46.88 
 
 
326 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  45.99 
 
 
330 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  47.19 
 
 
352 aa  263  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  46.88 
 
 
326 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  42.81 
 
 
337 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  45.43 
 
 
316 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  45.43 
 
 
316 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  47.81 
 
 
326 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.83 
 
 
322 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  44.16 
 
 
784 aa  256  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  42.54 
 
 
320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2111  ferredoxin-oxidoreductase FAD/NAD(P)- binding, ring hydroxylating dioxygenase reductase subunit  44.55 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  46.1 
 
 
318 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  43.22 
 
 
322 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  41.59 
 
 
319 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2150  ferredoxin  43.75 
 
 
324 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  45.17 
 
 
319 aa  242  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  42.41 
 
 
783 aa  241  9e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  43.34 
 
 
784 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  41.46 
 
 
588 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  43.34 
 
 
784 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  43.34 
 
 
784 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  43.61 
 
 
319 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  43.34 
 
 
784 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  39.5 
 
 
322 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  42.39 
 
 
782 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  40.38 
 
 
788 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  41.96 
 
 
351 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  42.9 
 
 
784 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  42.9 
 
 
784 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  43.21 
 
 
784 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  41.01 
 
 
320 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  40.49 
 
 
780 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  39.94 
 
 
320 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  39.94 
 
 
320 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3159  ferredoxin  45.31 
 
 
322 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5676  ferredoxin  44.2 
 
 
323 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0301762  normal  0.0416479 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  42.14 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5899  ferredoxin  44.51 
 
 
323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.985129  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5138  ferredoxin  45.82 
 
 
325 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  41.56 
 
 
324 aa  232  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.88 
 
 
783 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  43.17 
 
 
319 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  41.01 
 
 
316 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  43.04 
 
 
774 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3141  ferredoxin  45.37 
 
 
322 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  39.94 
 
 
321 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  40.19 
 
 
328 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  43.22 
 
 
316 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  40.94 
 
 
788 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  40.06 
 
 
320 aa  225  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  40.52 
 
 
794 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  40.69 
 
 
323 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.32 
 
 
317 aa  221  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  38.11 
 
 
1070 aa  221  9e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>