More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0419 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  100 
 
 
321 aa  653    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  90.03 
 
 
321 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  87.85 
 
 
321 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  87.85 
 
 
321 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  87.23 
 
 
321 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  87.23 
 
 
321 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  60.5 
 
 
322 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  58.57 
 
 
321 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  58.88 
 
 
323 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  60.87 
 
 
322 aa  388  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  58.39 
 
 
320 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  58.04 
 
 
323 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  52.81 
 
 
322 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  54.81 
 
 
316 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  56.65 
 
 
315 aa  350  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  54.81 
 
 
316 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  55.52 
 
 
325 aa  349  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  54.49 
 
 
316 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  53.53 
 
 
316 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  52.53 
 
 
317 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  51.27 
 
 
316 aa  329  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  50.95 
 
 
316 aa  328  7e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  50.78 
 
 
319 aa  324  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  53.92 
 
 
317 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  53.92 
 
 
317 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  48.42 
 
 
320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  51.08 
 
 
332 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  49.06 
 
 
323 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  51.09 
 
 
319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  48.55 
 
 
344 aa  298  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  52.65 
 
 
317 aa  298  1e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  47.78 
 
 
315 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  47.92 
 
 
320 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  46.73 
 
 
319 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  46.86 
 
 
318 aa  290  3e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  46.54 
 
 
331 aa  282  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  46.52 
 
 
317 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  44.86 
 
 
320 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  43.04 
 
 
318 aa  271  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  45.03 
 
 
319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  43.94 
 
 
337 aa  264  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  45.6 
 
 
326 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  43.61 
 
 
334 aa  261  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  40.99 
 
 
330 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  47.32 
 
 
324 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2111  ferredoxin-oxidoreductase FAD/NAD(P)- binding, ring hydroxylating dioxygenase reductase subunit  45.12 
 
 
325 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  44.58 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  47.84 
 
 
319 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2150  ferredoxin  44.65 
 
 
324 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.75 
 
 
318 aa  249  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  40.69 
 
 
322 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  44.27 
 
 
316 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  44.27 
 
 
316 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5138  ferredoxin  46.79 
 
 
325 aa  249  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  41.18 
 
 
320 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  44.41 
 
 
321 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  40.94 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  40.94 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5676  ferredoxin  43.89 
 
 
323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0301762  normal  0.0416479 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5899  ferredoxin  43.89 
 
 
323 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.985129  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  39.81 
 
 
322 aa  241  9e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  43.69 
 
 
784 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  41.01 
 
 
588 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  43.12 
 
 
352 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3141  ferredoxin  45.31 
 
 
322 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  42.3 
 
 
330 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  42.02 
 
 
325 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  43.53 
 
 
318 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  42.94 
 
 
321 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  41.07 
 
 
323 aa  236  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  40.5 
 
 
788 aa  236  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  42.27 
 
 
351 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3566  ferredoxin  42.86 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  41.9 
 
 
326 aa  231  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  42.2 
 
 
326 aa  231  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  40.06 
 
 
319 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  43.26 
 
 
320 aa  228  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  41.09 
 
 
333 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  41.09 
 
 
333 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  42.6 
 
 
330 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  43.65 
 
 
319 aa  226  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  44.66 
 
 
784 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  44.34 
 
 
784 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  44.34 
 
 
784 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  44.34 
 
 
784 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  44.34 
 
 
784 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  42.06 
 
 
782 aa  225  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  44.34 
 
 
784 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  44.34 
 
 
784 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  41.9 
 
 
326 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  42.33 
 
 
324 aa  225  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  40.51 
 
 
320 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  43.37 
 
 
783 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  38.87 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  38.87 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  38.56 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2680  ferredoxin  41.44 
 
 
328 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.62 
 
 
317 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  40.56 
 
 
319 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  38.24 
 
 
321 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>