More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3141 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3141  ferredoxin  100 
 
 		 322 aa  642    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5138  ferredoxin  76.92 
 
 		 325 aa  484  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  44.48 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  44.69 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  43.65 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  46.56 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  44.06 
 
 		 321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  44.06 
 
 		 321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  44.06 
 
 		 321 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  45.31 
 
 		 321 aa  252  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  45.37 
 
 		 323 aa  249  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  42.99 
 
 		 321 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  43.33 
 
 		 323 aa  248  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  45.94 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  44.06 
 
 		 317 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  43.71 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  40.62 
 
 		 322 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  45.26 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  44.44 
 
 		 316 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  43.48 
 
 		 319 aa  238  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  46.73 
 
 		 316 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  42.33 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  42.59 
 
 		 351 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  46.73 
 
 		 315 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.14 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  45.48 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  44.17 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  44 
 
 		 352 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  43.88 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  43.25 
 
 		 588 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  43.03 
 
 		 330 aa  231  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  40.87 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  44.38 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  40.87 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  44.77 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  38.49 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  45.09 
 
 		 320 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  41.82 
 
 		 337 aa  230  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  44.31 
 
 		 326 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  43.79 
 
 		 316 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  43.46 
 
 		 316 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  40.19 
 
 		 323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  40 
 
 		 326 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  48.22 
 
 		 317 aa  223  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  42.59 
 
 		 321 aa  222  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  35.62 
 
 		 318 aa  222  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.98 
 
 		 322 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  39.12 
 
 		 784 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  38.32 
 
 		 788 aa  219  7e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  43.14 
 
 		 324 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  38.7 
 
 		 322 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  40.19 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.52 
 
 		 315 aa  215  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  44.89 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  34.85 
 
 		 330 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  40.4 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3566  ferredoxin  41.41 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  41.51 
 
 		 318 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  43.3 
 
 		 783 aa  210  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2150  ferredoxin  40.12 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  41.72 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  39.69 
 
 		 332 aa  208  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  43.26 
 
 		 784 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  43.26 
 
 		 784 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  43.26 
 
 		 784 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  43.26 
 
 		 784 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  40.13 
 
 		 788 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  42.95 
 
 		 784 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  42.95 
 
 		 784 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  42.63 
 
 		 784 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.69 
 
 		 783 aa  205  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  38.39 
 
 		 317 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2111  ferredoxin-oxidoreductase FAD/NAD(P)- binding, ring hydroxylating dioxygenase reductase subunit  39.26 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.58 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  38.99 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  36.56 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  41.09 
 
 		 330 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  40.46 
 
 		 320 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  42.24 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  39.63 
 
 		 782 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  40.19 
 
 		 315 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  37.69 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4341  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.18 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  41.04 
 
 		 794 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  39.57 
 
 		 317 aa  192  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  38.91 
 
 		 318 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  37.69 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  37.69 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  39.18 
 
 		 323 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  41.61 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  35.22 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  39.1 
 
 		 344 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  38.89 
 
 		 318 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  36.74 
 
 		 1069 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  39.32 
 
 		 775 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  38.01 
 
 		 780 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  37.89 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  37.69 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  37.88 
 
 		 321 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2680  ferredoxin  40.67 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>