More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7584 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  100 
 
 
323 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  51.86 
 
 
322 aa  334  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  48.75 
 
 
323 aa  324  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  51.09 
 
 
321 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  49.53 
 
 
321 aa  315  9.999999999999999e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  50.47 
 
 
321 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  50.16 
 
 
321 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  50.16 
 
 
321 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  50.16 
 
 
321 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  49.53 
 
 
322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  47.48 
 
 
323 aa  300  3e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  47.65 
 
 
322 aa  295  9e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  49.06 
 
 
321 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  47.35 
 
 
320 aa  291  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  49.48 
 
 
320 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  46.11 
 
 
325 aa  288  6e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  46.37 
 
 
316 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  45.89 
 
 
316 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  46.06 
 
 
316 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  44.3 
 
 
317 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  45.43 
 
 
316 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  45.43 
 
 
316 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  45.43 
 
 
316 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  46.35 
 
 
315 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  43.4 
 
 
315 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  48.11 
 
 
317 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  44.69 
 
 
332 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  47.17 
 
 
319 aa  265  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  43.35 
 
 
319 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  45.28 
 
 
319 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  44 
 
 
344 aa  255  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  43.51 
 
 
317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  42.55 
 
 
320 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  41.88 
 
 
317 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  41.92 
 
 
318 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  42.77 
 
 
334 aa  248  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.75 
 
 
331 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  38.68 
 
 
318 aa  242  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  40.99 
 
 
317 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  40 
 
 
588 aa  235  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  42.86 
 
 
784 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  39.87 
 
 
788 aa  229  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  36.36 
 
 
320 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  40.94 
 
 
326 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  39.94 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5676  ferredoxin  38.24 
 
 
323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0301762  normal  0.0416479 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.65 
 
 
318 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5138  ferredoxin  42.46 
 
 
325 aa  211  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5899  ferredoxin  37.93 
 
 
323 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.985129  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  37.79 
 
 
782 aa  205  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  35.4 
 
 
330 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  37.65 
 
 
316 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  37.65 
 
 
316 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  36.28 
 
 
319 aa  202  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  36.22 
 
 
309 aa  202  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  36.81 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3141  ferredoxin  39.88 
 
 
322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  35.76 
 
 
320 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.56 
 
 
316 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  37.76 
 
 
794 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  36.02 
 
 
321 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.45 
 
 
322 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3566  ferredoxin  39.93 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2193  ferredoxin  38.27 
 
 
323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0744529  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.06 
 
 
783 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  37.77 
 
 
319 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0628  ferredoxin  37.61 
 
 
319 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544899  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  38.72 
 
 
780 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0171  ferredoxin  38.78 
 
 
316 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  36.96 
 
 
318 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  37.35 
 
 
321 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  37.46 
 
 
321 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1752  oxidoreductase  37.46 
 
 
316 aa  192  7e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000180781 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  36.05 
 
 
320 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1517  oxidoreductase  37.46 
 
 
321 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  38.19 
 
 
327 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3159  ferredoxin  36.09 
 
 
322 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  36.24 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  36.27 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  36.73 
 
 
333 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  36.73 
 
 
333 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2150  ferredoxin  36.88 
 
 
324 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.78 
 
 
317 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  36.39 
 
 
319 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  35.38 
 
 
319 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  38.46 
 
 
315 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  35.4 
 
 
321 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3939  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase / oxidoreductase, NAD-dependent  33.95 
 
 
558 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2111  ferredoxin-oxidoreductase FAD/NAD(P)- binding, ring hydroxylating dioxygenase reductase subunit  36.62 
 
 
325 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  38.26 
 
 
321 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  35.4 
 
 
321 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  35.09 
 
 
321 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  35.4 
 
 
321 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  37.92 
 
 
775 aa  186  4e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  36.82 
 
 
783 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  36.7 
 
 
352 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  36.14 
 
 
315 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  35.4 
 
 
321 aa  186  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  37.46 
 
 
784 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  35.69 
 
 
1070 aa  185  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>