More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7699 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  100 
 
 
326 aa  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  50.63 
 
 
316 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  50.63 
 
 
316 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  50.32 
 
 
316 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  49.51 
 
 
322 aa  301  7.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  49.68 
 
 
316 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  50.16 
 
 
317 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  48.21 
 
 
321 aa  288  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  49.35 
 
 
316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  47.73 
 
 
316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  48.57 
 
 
317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  48.06 
 
 
323 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  46.58 
 
 
321 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  46.58 
 
 
321 aa  279  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  47.32 
 
 
317 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  49.35 
 
 
322 aa  276  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  46.58 
 
 
321 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  46.37 
 
 
323 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  46.77 
 
 
332 aa  269  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  44.79 
 
 
318 aa  269  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  45.6 
 
 
321 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  45.93 
 
 
321 aa  268  8e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  45.64 
 
 
320 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  46.91 
 
 
319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  47.04 
 
 
325 aa  265  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  44.3 
 
 
322 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  46.08 
 
 
315 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  44.77 
 
 
318 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  43.99 
 
 
318 aa  262  6e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  45.6 
 
 
321 aa  258  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  45.91 
 
 
320 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  44.01 
 
 
316 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  44.01 
 
 
316 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  45.31 
 
 
327 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  43.4 
 
 
320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  45.86 
 
 
320 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  43.28 
 
 
322 aa  252  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  43.17 
 
 
319 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  43.93 
 
 
351 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  42.81 
 
 
322 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  41.8 
 
 
317 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2111  ferredoxin-oxidoreductase FAD/NAD(P)- binding, ring hydroxylating dioxygenase reductase subunit  42.68 
 
 
325 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  42.2 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  42.2 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  43.49 
 
 
334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  42.68 
 
 
784 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  43.03 
 
 
325 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  43 
 
 
315 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  43.81 
 
 
324 aa  240  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2150  ferredoxin  41.54 
 
 
324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  41.41 
 
 
337 aa  239  4e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  44.16 
 
 
321 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  43.65 
 
 
320 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  41.41 
 
 
320 aa  236  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  40.38 
 
 
788 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  42.02 
 
 
333 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  42.02 
 
 
333 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  39.17 
 
 
321 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  43.96 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  41.82 
 
 
784 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  41.82 
 
 
784 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  43.28 
 
 
774 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  41.53 
 
 
319 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  41.51 
 
 
784 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  41.51 
 
 
784 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  41.51 
 
 
784 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  41.51 
 
 
784 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  41.51 
 
 
784 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  44.27 
 
 
317 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  39.49 
 
 
316 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  42.59 
 
 
352 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  37.93 
 
 
330 aa  227  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  40.38 
 
 
324 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  40.06 
 
 
323 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  41.77 
 
 
330 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4341  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.88 
 
 
313 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  42.67 
 
 
321 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  40.67 
 
 
321 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  45.28 
 
 
319 aa  226  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.13 
 
 
331 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  41.67 
 
 
326 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  42.28 
 
 
326 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.46 
 
 
783 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  42.19 
 
 
319 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  42.07 
 
 
321 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  41.38 
 
 
321 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  42.41 
 
 
316 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  40.94 
 
 
323 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  40.25 
 
 
783 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  42.07 
 
 
321 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  41.07 
 
 
321 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  41.36 
 
 
326 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  38.89 
 
 
322 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  41.38 
 
 
321 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.75 
 
 
321 aa  222  6e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3566  ferredoxin  42.19 
 
 
322 aa  222  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  41.38 
 
 
321 aa  222  8e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  39.06 
 
 
319 aa  222  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  41.38 
 
 
321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  42.35 
 
 
317 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>