More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0531 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  100 
 
 
327 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  45.31 
 
 
326 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  42.68 
 
 
320 aa  255  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  45.65 
 
 
322 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  43.08 
 
 
320 aa  238  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  43.08 
 
 
320 aa  238  9e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  43.23 
 
 
323 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  44.48 
 
 
316 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  42.99 
 
 
320 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  46.67 
 
 
783 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  42.42 
 
 
320 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2459  ferredoxin  46.07 
 
 
317 aa  232  8.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0241293  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  43.97 
 
 
320 aa  232  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.14 
 
 
318 aa  231  9e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  42.35 
 
 
322 aa  231  9e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  46.67 
 
 
784 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  40.85 
 
 
322 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  46.67 
 
 
784 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  46.33 
 
 
784 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  45.85 
 
 
794 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  46.33 
 
 
784 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  46.33 
 
 
784 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  46.33 
 
 
784 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  40 
 
 
322 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  46.33 
 
 
784 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  43.05 
 
 
318 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  43 
 
 
780 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  41.98 
 
 
321 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  44.81 
 
 
784 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  42.45 
 
 
316 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  42.77 
 
 
316 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  42.68 
 
 
318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  43.93 
 
 
317 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  43.4 
 
 
782 aa  225  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  42.62 
 
 
321 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.23 
 
 
783 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  42.14 
 
 
316 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  40.5 
 
 
319 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4341  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.53 
 
 
313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  42.14 
 
 
316 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  44.95 
 
 
328 aa  222  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  42.81 
 
 
316 aa  222  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  42.81 
 
 
316 aa  222  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  40.25 
 
 
332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  40.06 
 
 
788 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  39.75 
 
 
323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  40.76 
 
 
333 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  40.76 
 
 
333 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  41.67 
 
 
319 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.34 
 
 
322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  43.3 
 
 
319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  42.9 
 
 
319 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  40.32 
 
 
315 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  40.2 
 
 
321 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  39.61 
 
 
321 aa  215  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  39.22 
 
 
321 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  42.71 
 
 
319 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  40.85 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  42.09 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  43.18 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  45.15 
 
 
774 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  42.02 
 
 
325 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40 
 
 
316 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  40 
 
 
317 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  41.14 
 
 
316 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  42.06 
 
 
317 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  41.8 
 
 
321 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  43.51 
 
 
326 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  41.48 
 
 
321 aa  209  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3159  ferredoxin  43.15 
 
 
322 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.87 
 
 
321 aa  209  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  43.85 
 
 
331 aa  208  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  40.85 
 
 
322 aa  208  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  38.56 
 
 
321 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  35.13 
 
 
318 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  38.24 
 
 
321 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  38.56 
 
 
321 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  43.51 
 
 
323 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  41.51 
 
 
330 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  41.16 
 
 
321 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  41.16 
 
 
321 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  41.2 
 
 
351 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  44.04 
 
 
330 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  42.26 
 
 
326 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.84 
 
 
321 aa  205  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  41.16 
 
 
321 aa  205  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2680  ferredoxin  42.77 
 
 
328 aa  205  8e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  39.46 
 
 
317 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.84 
 
 
321 aa  204  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  41.01 
 
 
321 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  37.46 
 
 
321 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  41.81 
 
 
315 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  38.28 
 
 
588 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.51 
 
 
321 aa  202  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  41.52 
 
 
320 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  43.04 
 
 
352 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.84 
 
 
321 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  44.38 
 
 
319 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  41.04 
 
 
321 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  41.94 
 
 
775 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>