More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2029 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  99.07 
 
 		 321 aa  664    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  98.75 
 
 		 321 aa  661    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  99.07 
 
 		 321 aa  662    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  99.38 
 
 		 321 aa  666    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  99.07 
 
 		 321 aa  664    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  100 
 
 		 321 aa  669    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  95.95 
 
 		 321 aa  652    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  98.44 
 
 		 321 aa  660    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  97.51 
 
 		 321 aa  653    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  58.88 
 
 		 321 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1517  oxidoreductase  59.19 
 
 		 321 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1752  oxidoreductase  59.18 
 
 		 316 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000180781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2193  ferredoxin  59.56 
 
 		 323 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0744529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  56.52 
 
 		 321 aa  361  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  50 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5646  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  41.54 
 
 		 321 aa  255  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0441  ferredoxin  44.16 
 
 		 317 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.476743 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6582  ferredoxin  41.23 
 
 		 321 aa  248  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.71028  normal  0.0286768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3313  ferredoxin  40.25 
 
 		 321 aa  245  8e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3584  phthalate 4,5-dioxygenase  42.86 
 
 		 318 aa  245  9e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.934292 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3181  ferredoxin  42.11 
 
 		 318 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0458671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  40.94 
 
 		 784 aa  238  9e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5962  ferredoxin  40.81 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0118173 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  40.49 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  42.77 
 
 		 309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0171  ferredoxin  41.27 
 
 		 316 aa  232  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3608  ferredoxin  39.25 
 
 		 317 aa  229  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.469867 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  39.06 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  39.08 
 
 		 320 aa  222  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  41.38 
 
 		 326 aa  222  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  39.56 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  39.14 
 
 		 323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  39.74 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  40.62 
 
 		 784 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  40.62 
 
 		 784 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  40.31 
 
 		 784 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  40.31 
 
 		 784 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  40.31 
 
 		 784 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  40.31 
 
 		 784 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  40.31 
 
 		 784 aa  219  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  38.36 
 
 		 322 aa  218  8.999999999999998e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  39.06 
 
 		 783 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  37.5 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  37.74 
 
 		 319 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  40.99 
 
 		 322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  39.07 
 
 		 316 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  39.07 
 
 		 316 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  39.14 
 
 		 325 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.75 
 
 		 316 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  38.94 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  35.85 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  37.92 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  39.07 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.07 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  36.79 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  36.79 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  39.6 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  37.81 
 
 		 315 aa  211  9e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  40.62 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  37.81 
 
 		 788 aa  210  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  38.24 
 
 		 321 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4341  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.2 
 
 		 313 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  39.06 
 
 		 321 aa  209  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  39.02 
 
 		 321 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  40.88 
 
 		 774 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.2 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  39.51 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  39.39 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  39.39 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  36.48 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  39.56 
 
 		 351 aa  205  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  36.99 
 
 		 320 aa  205  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  40.84 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  39.12 
 
 		 334 aa  202  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  37.24 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  38.63 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  37.3 
 
 		 780 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  39.62 
 
 		 782 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  37.81 
 
 		 320 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  37.38 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  36.76 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  37.96 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  37.38 
 
 		 775 aa  198  9e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  38.46 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  38.15 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  38.39 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  37.54 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.67 
 
 		 322 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  37.69 
 
 		 317 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  35.87 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2111  ferredoxin-oxidoreductase FAD/NAD(P)- binding, ring hydroxylating dioxygenase reductase subunit  37.54 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  37.54 
 
 		 326 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  37.24 
 
 		 588 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  33.85 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  38.08 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  37.23 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  34.77 
 
 		 331 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2150  ferredoxin  36.73 
 
 		 324 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  38.54 
 
 		 317 aa  192  9e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  35.11 
 
 		 788 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>