More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2761 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  100 
 
 
774 aa  1551    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  75.6 
 
 
333 aa  478  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  34.27 
 
 
788 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  36.99 
 
 
784 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  36.14 
 
 
782 aa  399  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  58.59 
 
 
333 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  58.59 
 
 
333 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.71 
 
 
783 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  34.62 
 
 
780 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  34.54 
 
 
788 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  35.38 
 
 
783 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  35.01 
 
 
784 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  35.01 
 
 
784 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  34.72 
 
 
784 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  34.72 
 
 
784 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  34.72 
 
 
784 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  34.72 
 
 
784 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  34.72 
 
 
784 aa  372  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  34.74 
 
 
794 aa  369  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  35.18 
 
 
775 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  59.87 
 
 
328 aa  338  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  33.96 
 
 
769 aa  338  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  53.94 
 
 
319 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  52.94 
 
 
316 aa  325  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  33.2 
 
 
754 aa  321  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  54.14 
 
 
331 aa  310  9e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  51.88 
 
 
321 aa  307  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  49.02 
 
 
315 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2259  ferredoxin  50.48 
 
 
315 aa  272  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2298  ferredoxin  50.48 
 
 
315 aa  272  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2306  ferredoxin  50.48 
 
 
315 aa  272  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40796  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  47.92 
 
 
657 aa  263  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  45.02 
 
 
318 aa  259  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  44.34 
 
 
316 aa  256  8e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  44.34 
 
 
316 aa  256  8e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  37.35 
 
 
398 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  36.74 
 
 
395 aa  244  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  41.21 
 
 
322 aa  242  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  43.28 
 
 
326 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  39.74 
 
 
395 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0317  cytochrome P450  38.06 
 
 
398 aa  238  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  38.59 
 
 
398 aa  238  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1766  cytochrome P450  36.17 
 
 
405 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1785  cytochrome P450  36.17 
 
 
405 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1832  cytochrome P450  36.17 
 
 
405 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  36.69 
 
 
405 aa  235  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  36.69 
 
 
405 aa  235  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  38.08 
 
 
395 aa  234  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  36.69 
 
 
405 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  43.04 
 
 
323 aa  234  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  39.75 
 
 
395 aa  233  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4341  ferredoxin  43.61 
 
 
379 aa  233  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  35.65 
 
 
427 aa  232  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  35.18 
 
 
412 aa  231  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3709  cytochrome P450  36.6 
 
 
400 aa  231  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681823  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3769  cytochrome P450  36.86 
 
 
400 aa  230  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.526814  normal  0.744364 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3696  cytochrome P450  36.86 
 
 
400 aa  230  6e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  34.89 
 
 
395 aa  230  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0477  ferredoxin  40.5 
 
 
385 aa  230  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2477  cytochrome P450  35.35 
 
 
401 aa  229  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2552  cytochrome P450  39.23 
 
 
401 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2597  cytochrome P450  39.23 
 
 
401 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138605  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  43.31 
 
 
322 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2591  cytochrome P450  38.98 
 
 
401 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  46.23 
 
 
368 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  46.23 
 
 
368 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  46.23 
 
 
368 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  43.21 
 
 
320 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  36.39 
 
 
396 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2001  cytochrome P450  35.63 
 
 
405 aa  225  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.717574  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  45.15 
 
 
327 aa  225  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  41.31 
 
 
319 aa  223  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3426  ferredoxin  46.84 
 
 
351 aa  223  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  41.25 
 
 
320 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  37.19 
 
 
388 aa  222  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  43.09 
 
 
319 aa  221  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  41.19 
 
 
321 aa  219  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  40.88 
 
 
321 aa  219  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4029  cytochrome P450  36.21 
 
 
398 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717223 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  40.45 
 
 
322 aa  219  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  40.88 
 
 
321 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  40.88 
 
 
321 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.64 
 
 
322 aa  218  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  38.36 
 
 
392 aa  217  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1201  cytochrome P450  36.03 
 
 
395 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0703508  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  42.24 
 
 
319 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.88 
 
 
321 aa  216  9e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3180  ferredoxin  45.57 
 
 
365 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.25 
 
 
321 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.88 
 
 
321 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1648  cytochrome P450  34.47 
 
 
396 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  33.99 
 
 
400 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  36.3 
 
 
411 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  41.19 
 
 
320 aa  216  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  36.17 
 
 
394 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  36.39 
 
 
394 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4175  cytochrome P450  35.03 
 
 
400 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498623  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4145  cytochrome P450  36.74 
 
 
398 aa  216  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.88 
 
 
321 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12789  oxidoreductase  44.55 
 
 
363 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.315864  normal  0.803284 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>