More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4880 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  100 
 
 		 332 aa  682    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  51.51 
 
 		 322 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  54.66 
 
 		 322 aa  334  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  55.16 
 
 		 316 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  51.53 
 
 		 322 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  54.52 
 
 		 316 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  52.8 
 
 		 316 aa  328  8e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  52.34 
 
 		 323 aa  328  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  53.23 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  53.87 
 
 		 316 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  52.48 
 
 		 323 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  53.55 
 
 		 316 aa  325  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  52.8 
 
 		 316 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  52.02 
 
 		 321 aa  322  5e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  51.39 
 
 		 317 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  50.16 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  51.09 
 
 		 315 aa  317  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  50.78 
 
 		 321 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  50.78 
 
 		 321 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  50.78 
 
 		 321 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  48.14 
 
 		 331 aa  305  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  50.47 
 
 		 321 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  49.53 
 
 		 321 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  51.08 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  49.38 
 
 		 317 aa  298  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  47.98 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  48.76 
 
 		 317 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  47.52 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  50.47 
 
 		 319 aa  287  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  47.66 
 
 		 315 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  46.11 
 
 		 320 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  45.96 
 
 		 319 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  46.13 
 
 		 334 aa  275  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  45.56 
 
 		 344 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  44.69 
 
 		 323 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  46.77 
 
 		 326 aa  269  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  48.77 
 
 		 317 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  44.89 
 
 		 320 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  41.3 
 
 		 318 aa  259  6e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  43.08 
 
 		 317 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  43.98 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.52 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  41.32 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  42.07 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  39.88 
 
 		 588 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  43.13 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  42.55 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  41.3 
 
 		 333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  41.3 
 
 		 333 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  39.38 
 
 		 320 aa  225  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  44.67 
 
 		 316 aa  225  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  41.05 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  40.73 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  41.05 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  38.55 
 
 		 320 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  42.55 
 
 		 318 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  40.25 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  39.08 
 
 		 322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3159  ferredoxin  41.98 
 
 		 322 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  39.26 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5676  ferredoxin  42.02 
 
 		 323 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0301762  normal  0.0416479 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5899  ferredoxin  42.02 
 
 		 323 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.985129  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3566  ferredoxin  40.87 
 
 		 322 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  40.5 
 
 		 320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  40.75 
 
 		 769 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5138  ferredoxin  40.96 
 
 		 325 aa  212  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  40.44 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  40.81 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  40.32 
 
 		 788 aa  209  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  39.51 
 
 		 351 aa  208  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.39 
 
 		 320 aa  208  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  41.61 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  35.4 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  39.32 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  39.58 
 
 		 784 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  37.8 
 
 		 323 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  39.58 
 
 		 784 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  39.87 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.49 
 
 		 783 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  40.31 
 
 		 784 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  40.31 
 
 		 784 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  40.31 
 
 		 784 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  40.31 
 
 		 784 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  40.31 
 
 		 784 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  41.53 
 
 		 754 aa  203  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  38.86 
 
 		 337 aa  202  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  40 
 
 		 783 aa  202  9e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  38.2 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  38.3 
 
 		 782 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  38.14 
 
 		 780 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  38.07 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  38.07 
 
 		 320 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  37.16 
 
 		 322 aa  199  6e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  37.42 
 
 		 784 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0628  ferredoxin  39.93 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.544899  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  38.7 
 
 		 325 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  38.53 
 
 		 330 aa  196  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  39.01 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  37.7 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3141  ferredoxin  39.69 
 
 		 322 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>