More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07060 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  62.65 
 
 
784 aa  1017    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  64.36 
 
 
782 aa  1076    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  62.65 
 
 
784 aa  1017    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  65.03 
 
 
783 aa  1064    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  62.65 
 
 
784 aa  1013    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  62.04 
 
 
783 aa  1019    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  62.26 
 
 
794 aa  1018    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  62.65 
 
 
784 aa  1016    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  65.42 
 
 
780 aa  1080    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  100 
 
 
788 aa  1640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  62.65 
 
 
784 aa  1017    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  66.09 
 
 
788 aa  1062    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  57.52 
 
 
769 aa  917    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  72.59 
 
 
784 aa  1182    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  62.91 
 
 
784 aa  1024    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  62.65 
 
 
784 aa  1017    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  60.88 
 
 
775 aa  994    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  34.27 
 
 
774 aa  388  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  38.55 
 
 
418 aa  302  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  28.46 
 
 
754 aa  280  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  48.36 
 
 
333 aa  279  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  48.36 
 
 
333 aa  279  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  47.35 
 
 
333 aa  273  9e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  43.27 
 
 
316 aa  259  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  42.37 
 
 
322 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  46.23 
 
 
328 aa  255  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  42.72 
 
 
322 aa  254  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  43.13 
 
 
316 aa  253  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  43.13 
 
 
316 aa  253  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  41.88 
 
 
320 aa  249  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  42.81 
 
 
321 aa  248  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  41.94 
 
 
315 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  32.79 
 
 
425 aa  246  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.59 
 
 
318 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  41.69 
 
 
321 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  41.69 
 
 
321 aa  242  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  41.69 
 
 
321 aa  242  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  42.53 
 
 
323 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  40.38 
 
 
323 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  40.75 
 
 
321 aa  239  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  42.55 
 
 
331 aa  238  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  40.66 
 
 
319 aa  238  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  40.38 
 
 
326 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  40.91 
 
 
321 aa  236  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2298  ferredoxin  43.04 
 
 
315 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2259  ferredoxin  43.04 
 
 
315 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379114  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2306  ferredoxin  43.04 
 
 
315 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40796  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  41.07 
 
 
325 aa  235  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  40.72 
 
 
316 aa  235  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  41.32 
 
 
316 aa  234  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.01 
 
 
316 aa  233  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  42.53 
 
 
315 aa  233  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  40.39 
 
 
316 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  40.5 
 
 
321 aa  232  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  40.07 
 
 
316 aa  231  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  39.87 
 
 
323 aa  229  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  39.74 
 
 
316 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  41.05 
 
 
320 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  40.92 
 
 
321 aa  226  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  39.81 
 
 
315 aa  225  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  40.06 
 
 
319 aa  225  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.82 
 
 
317 aa  225  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  40.78 
 
 
319 aa  223  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  38.92 
 
 
318 aa  222  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  39.31 
 
 
322 aa  221  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  40.06 
 
 
327 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  36.34 
 
 
1069 aa  220  8.999999999999998e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  40.13 
 
 
657 aa  219  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  41.14 
 
 
317 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  39.48 
 
 
325 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  38.63 
 
 
321 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  39.5 
 
 
319 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  37.54 
 
 
315 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  37.82 
 
 
320 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  37.81 
 
 
321 aa  213  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3180  ferredoxin  40.12 
 
 
365 aa  213  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  37.5 
 
 
321 aa  213  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4341  ferredoxin  40.06 
 
 
379 aa  211  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  38.6 
 
 
588 aa  211  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  39.16 
 
 
320 aa  211  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.81 
 
 
321 aa  211  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0477  ferredoxin  38.73 
 
 
385 aa  210  8e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.19 
 
 
321 aa  210  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  39.35 
 
 
326 aa  210  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.81 
 
 
321 aa  210  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  38.26 
 
 
320 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.5 
 
 
321 aa  209  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  40.32 
 
 
332 aa  209  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  37.54 
 
 
317 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  37.86 
 
 
351 aa  209  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.5 
 
 
321 aa  209  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  39.51 
 
 
368 aa  207  6e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  39.51 
 
 
368 aa  207  6e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3454  ferredoxin  38.29 
 
 
309 aa  207  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246796  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  39.51 
 
 
368 aa  207  6e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  35.53 
 
 
1070 aa  207  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  37.19 
 
 
321 aa  207  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  37.19 
 
 
321 aa  207  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  38.17 
 
 
321 aa  206  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  37.9 
 
 
334 aa  206  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>