More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0717 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  99.23 
 
 
784 aa  1578    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  61.44 
 
 
784 aa  935    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  99.74 
 
 
784 aa  1587    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  99.23 
 
 
784 aa  1583    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  70.82 
 
 
783 aa  1162    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  100 
 
 
784 aa  1593    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  92.58 
 
 
783 aa  1458    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  99.23 
 
 
784 aa  1583    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  62.65 
 
 
788 aa  1013    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  74.16 
 
 
788 aa  1179    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  99.23 
 
 
784 aa  1583    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  71.97 
 
 
780 aa  1151    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22450  cytochrome P450  60.65 
 
 
775 aa  920    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  72.39 
 
 
782 aa  1157    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  99.23 
 
 
784 aa  1583    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  58.79 
 
 
769 aa  903    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  69.91 
 
 
794 aa  1107    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  34.88 
 
 
774 aa  362  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  33.55 
 
 
754 aa  304  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  37.95 
 
 
418 aa  293  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  34.7 
 
 
425 aa  263  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  44.55 
 
 
333 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  44.55 
 
 
333 aa  255  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  46.33 
 
 
316 aa  247  8e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  46.33 
 
 
316 aa  247  8e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  42.5 
 
 
322 aa  245  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  50.16 
 
 
328 aa  243  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  44.76 
 
 
318 aa  240  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5925  ferredoxin  46.89 
 
 
315 aa  240  9e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0144605  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  42.9 
 
 
323 aa  239  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  45.45 
 
 
321 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  45.45 
 
 
321 aa  236  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  43.61 
 
 
320 aa  235  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  42.95 
 
 
322 aa  234  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  42.9 
 
 
320 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  43.91 
 
 
333 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  44.63 
 
 
319 aa  234  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  44.98 
 
 
321 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  46.67 
 
 
327 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  44.88 
 
 
315 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  45.45 
 
 
317 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  41.82 
 
 
326 aa  230  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  42.95 
 
 
316 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  43.14 
 
 
321 aa  229  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  41.69 
 
 
323 aa  227  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  46.08 
 
 
319 aa  227  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  43.91 
 
 
316 aa  226  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  44.33 
 
 
322 aa  226  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  42.44 
 
 
316 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  42.12 
 
 
316 aa  225  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  41.56 
 
 
316 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  41.8 
 
 
316 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  41.8 
 
 
316 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  42.62 
 
 
319 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  40.94 
 
 
321 aa  222  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  43.18 
 
 
321 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  40.62 
 
 
321 aa  221  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  43.37 
 
 
321 aa  222  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  40.62 
 
 
321 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  40.62 
 
 
321 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  43.51 
 
 
321 aa  221  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.62 
 
 
321 aa  220  7.999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.62 
 
 
321 aa  220  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.62 
 
 
321 aa  219  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  40.44 
 
 
320 aa  219  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  43.83 
 
 
315 aa  219  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  46.93 
 
 
331 aa  218  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.62 
 
 
321 aa  218  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  44.03 
 
 
322 aa  217  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  39.94 
 
 
321 aa  218  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  40.39 
 
 
320 aa  217  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  40.39 
 
 
320 aa  217  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  40.45 
 
 
325 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4832  ferredoxin  44.41 
 
 
309 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000030603  hitchhiker  0.00755842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0888  ferredoxin  43.61 
 
 
657 aa  214  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.986677  normal  0.535707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  42.32 
 
 
317 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  45.25 
 
 
317 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  40.51 
 
 
322 aa  214  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  45.57 
 
 
317 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  43.14 
 
 
319 aa  211  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3974  reductive dehalogenase  39.54 
 
 
1069 aa  211  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2259  ferredoxin  43.85 
 
 
315 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2298  ferredoxin  43.85 
 
 
315 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2306  ferredoxin  43.85 
 
 
315 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40796  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  43.13 
 
 
321 aa  209  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  41 
 
 
344 aa  208  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  42.09 
 
 
321 aa  207  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  41.46 
 
 
321 aa  207  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3566  ferredoxin  42.59 
 
 
322 aa  207  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  43.13 
 
 
318 aa  207  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  41.05 
 
 
325 aa  206  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  38.99 
 
 
351 aa  206  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  44.16 
 
 
368 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  44.16 
 
 
368 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  44.16 
 
 
368 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  39.58 
 
 
332 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3234  vanillate O-demethylase oxidoreductase  42.95 
 
 
316 aa  204  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.432272 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  41.12 
 
 
320 aa  204  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1492  ferredoxin  42.72 
 
 
330 aa  204  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  39.21 
 
 
337 aa  204  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>