More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4624 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4624  ferredoxin  100 
 
 		 322 aa  672    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  68.24 
 
 		 323 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  55.81 
 
 		 351 aa  351  8e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  51.92 
 
 		 320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  51.92 
 
 		 320 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  51.9 
 
 		 322 aa  334  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  43.22 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  44.34 
 
 		 322 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  41.38 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  42.53 
 
 		 316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  42.53 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  40.13 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  39.94 
 
 		 321 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  39.94 
 
 		 321 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  42.77 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  41.88 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  40.75 
 
 		 322 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  39.25 
 
 		 321 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1220  ferredoxin  45.15 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.399745  decreased coverage  0.00184226 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  39.13 
 
 		 321 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  42.27 
 
 		 320 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  40.68 
 
 		 323 aa  235  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.5 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40 
 
 		 316 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  41.23 
 
 		 316 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  40 
 
 		 322 aa  229  5e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.81 
 
 		 331 aa  225  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  38.89 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  42.95 
 
 		 318 aa  222  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  41.59 
 
 		 325 aa  222  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  41.38 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  39.81 
 
 		 319 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  38.36 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  40.31 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0968553 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  41.54 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  40.67 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  39.57 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  41.23 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  39.81 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  40.68 
 
 		 331 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  40 
 
 		 326 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  41.23 
 
 		 321 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  39.2 
 
 		 322 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  41.23 
 
 		 321 aa  215  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  41.23 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.92 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1385  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  41.23 
 
 		 321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  39.38 
 
 		 352 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2259  ferredoxin  41.25 
 
 		 315 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379114  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2298  ferredoxin  41.25 
 
 		 315 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2306  ferredoxin  41.25 
 
 		 315 aa  212  9e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.62 
 
 		 321 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  40.39 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  38.89 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  40 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  36.34 
 
 		 330 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  40 
 
 		 588 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  40.92 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  36.7 
 
 		 337 aa  209  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  41.5 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  39.29 
 
 		 317 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  40.85 
 
 		 327 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  38.2 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  38.36 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  40.06 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  39.24 
 
 		 321 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  35.96 
 
 		 315 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  38.73 
 
 		 317 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4832  ferredoxin  37.9 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000030603  hitchhiker  0.00755842 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  40.84 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  37.27 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  38.87 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  37.27 
 
 		 316 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4341  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.19 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  36.79 
 
 		 320 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3141  ferredoxin  38.7 
 
 		 322 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  38.33 
 
 		 319 aa  202  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  37.27 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  36.14 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5138  ferredoxin  38.25 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  38.66 
 
 		 333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  37.16 
 
 		 332 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  37.7 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  42 
 
 		 315 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  38.34 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2111  ferredoxin-oxidoreductase FAD/NAD(P)- binding, ring hydroxylating dioxygenase reductase subunit  37.77 
 
 		 325 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  37.86 
 
 		 784 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  40.07 
 
 		 333 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  40.07 
 
 		 333 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  39.29 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  35.91 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  37.18 
 
 		 318 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1752  oxidoreductase  40.95 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000180781 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2150  ferredoxin  37.65 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1620  ferredoxin  40.95 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  35.42 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  36.48 
 
 		 319 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  35.87 
 
 		 320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1517  oxidoreductase  40.95 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  39.18 
 
 		 774 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>