More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1003 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  100 
 
 		 315 aa  638    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  57.59 
 
 		 322 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  59.18 
 
 		 321 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  58.86 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  58.86 
 
 		 321 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  55.21 
 
 		 323 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  56.15 
 
 		 316 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  56.15 
 
 		 316 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  57.59 
 
 		 316 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  58.36 
 
 		 322 aa  357  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  56.01 
 
 		 316 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  57.28 
 
 		 321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  55.38 
 
 		 316 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  55.7 
 
 		 321 aa  354  1e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  56.01 
 
 		 321 aa  352  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  54.75 
 
 		 316 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  52.72 
 
 		 322 aa  351  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  56.92 
 
 		 320 aa  348  9e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  56.15 
 
 		 317 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  56.65 
 
 		 321 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  55.56 
 
 		 319 aa  330  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  54.09 
 
 		 317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  53.8 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  54.57 
 
 		 323 aa  326  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  52.05 
 
 		 317 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  52.22 
 
 		 320 aa  322  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  51.09 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  49.68 
 
 		 320 aa  309  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  50.63 
 
 		 319 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5517  vanillate O-demethylase oxidoreductase  48.74 
 
 		 331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  52.96 
 
 		 317 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  47.17 
 
 		 318 aa  299  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  47.78 
 
 		 315 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  48.1 
 
 		 319 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  46.2 
 
 		 317 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  47.4 
 
 		 344 aa  288  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1829  ferredoxin  47.15 
 
 		 334 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal  0.528944 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7584  ferredoxin  46.35 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0869  ferredoxin  41.64 
 
 		 318 aa  265  7e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  46.08 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0406  putative 2Fe-2S ferrodoxin  49.37 
 
 		 324 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  42.99 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1909  phthalate 4,5-dioxygenase, reductase subunit  44.97 
 
 		 351 aa  245  6e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  42.32 
 
 		 320 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  43.31 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  45.1 
 
 		 318 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  42.22 
 
 		 319 aa  239  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  43.71 
 
 		 321 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  45.02 
 
 		 325 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  45.6 
 
 		 321 aa  238  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  41.01 
 
 		 588 aa  237  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  44.55 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  44.77 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  44.77 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2150  ferredoxin  45.66 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  45.17 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2111  ferredoxin-oxidoreductase FAD/NAD(P)- binding, ring hydroxylating dioxygenase reductase subunit  45.4 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  45.17 
 
 		 326 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  40.51 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  40.44 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3566  ferredoxin  43.53 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  40.44 
 
 		 333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  44.86 
 
 		 326 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.49 
 
 		 322 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  44.55 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  41.08 
 
 		 784 aa  229  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  45.48 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2925  ferredoxin  41.82 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4812  ferredoxin  38.56 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7074  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  43.52 
 
 		 319 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0880566  normal  0.833483 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  41.07 
 
 		 320 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  41.32 
 
 		 782 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  43.51 
 
 		 783 aa  222  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5138  ferredoxin  46.45 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  39.94 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5676  ferredoxin  44.97 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0301762  normal  0.0416479 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5899  ferredoxin  43.85 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.985129  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  44.16 
 
 		 784 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  43.83 
 
 		 784 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  40.07 
 
 		 321 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  43.83 
 
 		 784 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  43.83 
 
 		 784 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  43.83 
 
 		 784 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  43.83 
 
 		 784 aa  219  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  43.83 
 
 		 784 aa  219  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  42.07 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3141  ferredoxin  45.31 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  37.54 
 
 		 788 aa  215  8e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  38.44 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  38.12 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  40.68 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3578  reductive dehalogenase  39.74 
 
 		 1070 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.960062  normal  0.192167 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  38.12 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  38.12 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  41.69 
 
 		 318 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3393  ferredoxin  42.63 
 
 		 754 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205639 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2786  ferredoxin  37.62 
 
 		 320 aa  212  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224579  normal  0.0721764 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4965  ferredoxin  37.62 
 
 		 320 aa  212  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.222707  normal  0.0138132 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  38.12 
 
 		 321 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  37.81 
 
 		 321 aa  211  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>