More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4632 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4632  ferredoxin  100 
 
 		 316 aa  639    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189827  normal  0.0263883 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4500  ferredoxin  100 
 
 		 316 aa  639    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125259  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3579  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  78.85 
 
 		 318 aa  511  1e-144  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147796  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0965  ferredoxin  59.25 
 
 		 319 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3159  ferredoxin  59.32 
 
 		 322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3680  ferredoxin  57.37 
 
 		 319 aa  352  5e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  53.21 
 
 		 318 aa  326  4.0000000000000003e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5777  phthalate 4,5-dioxygenase  51.92 
 
 		 320 aa  322  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4797  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  50.31 
 
 		 322 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290636  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0343  ferredoxin  47.81 
 
 		 322 aa  278  6e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2026  ferredoxin  45.75 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2899  ferredoxin  45.66 
 
 		 333 aa  269  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3737  ferredoxin  45.1 
 
 		 316 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2369  putative phthalate 4,5-dioxygenase reductase subunit (OhpA1)  45.08 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00138771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4894  ferredoxin  45.11 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.373479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5549  phenoxybenzoate dioxygenase subunit beta  44.72 
 
 		 321 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4243  ferredoxin  44.86 
 
 		 324 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2169  ferredoxin  44.44 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0772713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64810  vanillate O-demethylase oxidoreductase  48.09 
 
 		 317 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0251554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  48.73 
 
 		 317 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6765  ferredoxin-NADPH reductase  45.43 
 
 		 323 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.976153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2298  ferredoxin  45.62 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  0.61988 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2259  ferredoxin  45.62 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379114  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2306  ferredoxin  45.62 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4341  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.49 
 
 		 313 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2044  ferredoxin  45.42 
 
 		 316 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7699  ferredoxin  44.01 
 
 		 326 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.765458 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5694  Phthalate 4,5-dioxygenase  44.72 
 
 		 321 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  45.43 
 
 		 321 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2709  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.77 
 
 		 316 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0305444  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4932  ferredoxin, cytochrome P450  43.49 
 
 		 780 aa  254  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2905  vanillate O-demethylase oxidoreductase  42.72 
 
 		 316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144739  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  44.97 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07060  cytochrome P450  43.13 
 
 		 788 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.75333  normal  0.497051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4592  ferredoxin  44.38 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10970  putative flavodoxin reductase  44.97 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  45.43 
 
 		 321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  45.43 
 
 		 321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2724  ferredoxin  43.79 
 
 		 322 aa  252  7e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.0138338 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5125  ferredoxin  43.75 
 
 		 321 aa  249  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.272178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2761  ferredoxin  43.69 
 
 		 774 aa  249  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.843778  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3200  ferredoxin  44.65 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1520  ferredoxin  43.56 
 
 		 333 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1543  ferredoxin  43.56 
 
 		 333 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0289  putative iron-sulfur oxidoreductase, beta subunit  44.23 
 
 		 316 aa  248  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.600768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5870  ferredoxin  44.08 
 
 		 588 aa  248  9e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0725  cytochrome P450  46.01 
 
 		 783 aa  248  9e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207773  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1669  cytochrome P450  46.33 
 
 		 784 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0717  cytochrome P450  46.33 
 
 		 784 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1914  cytochrome P450  46.33 
 
 		 784 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0588  cytochrome P450  46.33 
 
 		 784 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2323  cytochrome P450  46.65 
 
 		 784 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1707  cytochrome P450  46.33 
 
 		 784 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.732396  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2242  cytochrome P450 family protein  46.33 
 
 		 784 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1111  ferredoxin  44.44 
 
 		 784 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.734478  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0329  oxidoreductase  44.16 
 
 		 321 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  42.9 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0281  ferredoxin  41.74 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.985889  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3536  aromatic acid dioxygenase beta subunit  42.68 
 
 		 321 aa  242  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.304315 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  44.48 
 
 		 315 aa  242  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5958  ferredoxin  42.62 
 
 		 788 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962015  normal  0.081957 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3899  ferredoxin  42.63 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83254  normal  0.447965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1957  Pdr/VanB family oxidoreductase  43.12 
 
 		 317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.334574  hitchhiker  0.000300419 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  41.35 
 
 		 783 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3221  ferredoxin  44.44 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5072  ferredoxin  43.93 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.14092 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1003  vanillate O-demethylase oxidoreductase  44.77 
 
 		 315 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0419  ferredoxin/oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  44.27 
 
 		 321 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3942  ferredoxin  43.35 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3118  ferredoxin  42.77 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2494  ferredoxin  42.46 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0494145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3596  ferredoxin  43.93 
 
 		 782 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0995  ferredoxin  43.32 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000440652 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3621  ferredoxin  42.68 
 
 		 326 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0766898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0687  ferredoxin  44.55 
 
 		 794 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0999  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  43.28 
 
 		 318 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1542  ferredoxin  38.58 
 
 		 330 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5830  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.31 
 
 		 317 aa  228  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5357  ferredoxin  42.81 
 
 		 326 aa  228  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1100  vanillate O-demethylase reductase subunit VanB  41.8 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3096  ferredoxin  42.9 
 
 		 769 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.367454 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3527  ferredoxin  42.37 
 
 		 326 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6337  ferredoxin  40.13 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.424849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2212  ferredoxin  40.81 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2150  ferredoxin  41.36 
 
 		 324 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1297  ferredoxin  41.51 
 
 		 318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1726  phthalate 4,5-dioxygenase  41.83 
 
 		 321 aa  225  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.53937  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5676  ferredoxin  41.72 
 
 		 323 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0301762  normal  0.0416479 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0554  putative iron-sulfur oxidoreductase subunit  40.24 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2111  ferredoxin-oxidoreductase FAD/NAD(P)- binding, ring hydroxylating dioxygenase reductase subunit  41.64 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4880  ferredoxin  41.05 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.797791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  42.09 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5899  ferredoxin  41.05 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.985129  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0531  ferredoxin  42.81 
 
 		 327 aa  222  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4112  oxidoreductase/oxygenase, vanB family  42.81 
 
 		 317 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2905  ferredoxin  42.81 
 
 		 368 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2919  ferredoxin  42.81 
 
 		 368 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0803  putative ferredoxin-containing oxidoreductase  40.12 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2875  ferredoxin  42.81 
 
 		 368 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3265  ferredoxin  41.77 
 
 		 319 aa  219  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>