More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4192 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4192  ferredoxin  100 
 
 
98 aa  202  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3652  ferredoxin  37.66 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.07 
 
 
363 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.63 
 
 
367 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4353  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.07 
 
 
331 aa  63.5  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.58 
 
 
356 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  35.63 
 
 
366 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.29 
 
 
340 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.37 
 
 
366 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.37 
 
 
390 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.63 
 
 
366 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2281  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  40 
 
 
335 aa  61.6  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.37 
 
 
368 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3111  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.47 
 
 
351 aa  61.6  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461281  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.37 
 
 
366 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.06 
 
 
342 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  32.22 
 
 
368 aa  60.5  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.88 
 
 
363 aa  60.5  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.12 
 
 
353 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.65 
 
 
345 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5660  ferredoxin  38.57 
 
 
103 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.926642 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2280  phenol hydrolase reductase  34.12 
 
 
352 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4067  ferredoxin  31.03 
 
 
319 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.33 
 
 
354 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  32.94 
 
 
366 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.33 
 
 
354 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  32.94 
 
 
366 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3715  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.72 
 
 
467 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437326  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3690  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.72 
 
 
468 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1704  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.29 
 
 
352 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.59364  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4923  ferredoxin  35.14 
 
 
100 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.46 
 
 
350 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.58 
 
 
336 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2702  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.65 
 
 
349 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.46 
 
 
350 aa  58.2  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1074  ferredoxin-(2Fe-2S)-binding protein  37.14 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1782  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.12 
 
 
356 aa  57.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.241657  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3640  ferredoxin  36.49 
 
 
105 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4404  ferredoxin  35.14 
 
 
100 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2966  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  38.67 
 
 
354 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0998683  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3358  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36 
 
 
354 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5685  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  37.14 
 
 
354 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0697  ferredoxin  37.14 
 
 
100 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812143  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2312  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.47 
 
 
349 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.535707  hitchhiker  0.000181189 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5307  ferredoxin  37.14 
 
 
100 aa  57  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.786726  normal  0.0713222 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4051  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.14 
 
 
342 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548606  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  32.93 
 
 
366 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.94 
 
 
349 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  31.4 
 
 
418 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2791  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.29 
 
 
354 aa  57.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.329322 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4980  ferredoxin  37.14 
 
 
100 aa  57  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786925  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3387  ferredoxin  37.14 
 
 
100 aa  57  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.864897  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0596  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.52 
 
 
343 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.491585  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3428  ferredoxin  38.57 
 
 
129 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.883916  normal  0.379266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0829  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.71 
 
 
343 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0888  2Fe-2S iron-sulfur  34.72 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225976  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2159  2Fe-2S iron-sulfur  34.72 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0798  iron-sulfur cluster-binding protein  34.72 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2434  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.47 
 
 
349 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.890562  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1820  2Fe-2S iron-sulfur  35.71 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3434  ferredoxin  40.3 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0530  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.06 
 
 
352 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3138  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.71 
 
 
343 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0223  vanillate O-demethylase  36 
 
 
317 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000934842  normal  0.0801179 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0151  putative ferredoxin  36.9 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0245789  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30710  Multi-component phenol hydoxylase, reductase subunit; LapP  31.76 
 
 
353 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431626  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2756  ferredoxin  30.12 
 
 
111 aa  55.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.108856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.23 
 
 
414 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  32.18 
 
 
355 aa  55.1  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3426  ferredoxin  41.67 
 
 
351 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2173  vanillate O-demethylase oxidoreductase  36.76 
 
 
320 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.23964  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2107  flavodoxin reductase (ferredoxin-NADPH reductase) family protein 1-like protein  37.5 
 
 
336 aa  54.7  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.823248 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3792  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.06 
 
 
353 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000109386  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4329  ferredoxin  32.94 
 
 
320 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.042189 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1380  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.43 
 
 
363 aa  54.3  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.611376  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5244  ferredoxin  32.95 
 
 
321 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3123  ferredoxin  32.95 
 
 
321 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.354063  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5028  phthalate 4,5-dioxygenase  32.95 
 
 
321 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  31.76 
 
 
342 aa  53.9  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3213  ferredoxin  33.33 
 
 
344 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289084  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  32.91 
 
 
342 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  27.59 
 
 
365 aa  53.9  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0057  putative vanillate O-demethylase oxidoreductase  34.18 
 
 
315 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1334  phthalate 4,5-dioxygenase  32.5 
 
 
322 aa  53.9  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.841551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1368  ferredoxin  31.52 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.996751  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1356  phthalate 4,5-dioxygenase  34.72 
 
 
320 aa  53.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5630  vanillate O-demethylase oxidoreductase  33.33 
 
 
317 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  33.33 
 
 
627 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.72 
 
 
337 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  32.97 
 
 
647 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0805  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.95 
 
 
343 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2255  ferredoxin  35.06 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  34.12 
 
 
322 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2765  ferredoxin  35.06 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174551  normal  0.655324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1828  putative CDP-6-deoxy-delta-3,4- glucoseen reductase  29.76 
 
 
341 aa  52.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3630  multidomain oxidoreductase  30.38 
 
 
334 aa  52.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0882  ferredoxin  32.61 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0891946  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  29.21 
 
 
357 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3306  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.76 
 
 
353 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592709  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  36.11 
 
 
362 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>