More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1005 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  100 
 
 
368 aa  771    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  76.09 
 
 
366 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  76.09 
 
 
366 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  73.91 
 
 
366 aa  579  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  74.11 
 
 
367 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  73.1 
 
 
366 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  72.83 
 
 
368 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  72.55 
 
 
366 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  72.28 
 
 
366 aa  569  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  72.55 
 
 
390 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  73.1 
 
 
366 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  68.77 
 
 
396 aa  552  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  63.89 
 
 
365 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.25 
 
 
382 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  46.81 
 
 
380 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  46.54 
 
 
380 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  46.54 
 
 
381 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  46.28 
 
 
381 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  46.28 
 
 
380 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  46.28 
 
 
380 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  46.28 
 
 
380 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.68 
 
 
385 aa  328  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.67 
 
 
382 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  47.67 
 
 
382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.67 
 
 
382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  46.98 
 
 
382 aa  325  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  44.29 
 
 
355 aa  325  6e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  46.59 
 
 
394 aa  323  4e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.21 
 
 
382 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.21 
 
 
382 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  47.7 
 
 
379 aa  322  8e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46.63 
 
 
414 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  46.07 
 
 
382 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  45.33 
 
 
418 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  45.26 
 
 
386 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  46.69 
 
 
375 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  46.69 
 
 
358 aa  315  6e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  46.69 
 
 
379 aa  315  7e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.24 
 
 
381 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.82 
 
 
375 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.09 
 
 
375 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.74 
 
 
361 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  43.38 
 
 
364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  43.13 
 
 
372 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  42.3 
 
 
362 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5978  ferredoxin  43.14 
 
 
364 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.430172  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  43.42 
 
 
383 aa  296  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  43.38 
 
 
355 aa  296  5e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  42.54 
 
 
372 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  43.45 
 
 
353 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  43.42 
 
 
381 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  44.96 
 
 
363 aa  281  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.69 
 
 
374 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.95 
 
 
356 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.55 
 
 
363 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.21 
 
 
367 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  41.54 
 
 
606 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  41.54 
 
 
606 aa  272  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.8 
 
 
403 aa  263  4e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.73 
 
 
380 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.45 
 
 
380 aa  259  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  39.89 
 
 
356 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  40.29 
 
 
387 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.89 
 
 
376 aa  257  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  39.28 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.71 
 
 
406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  38.31 
 
 
388 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  39.2 
 
 
371 aa  246  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.86 
 
 
407 aa  232  9e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  39.94 
 
 
325 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  38.11 
 
 
585 aa  223  3e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  34.29 
 
 
342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.55 
 
 
702 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.78 
 
 
585 aa  206  6e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  32.29 
 
 
627 aa  200  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  36.21 
 
 
625 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  32.96 
 
 
670 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  32.89 
 
 
597 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3715  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.78 
 
 
467 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437326  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.79 
 
 
669 aa  195  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  33.53 
 
 
662 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  30.95 
 
 
605 aa  187  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  30.19 
 
 
373 aa  185  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003800  NADH oxidoreductase Hcr  31.75 
 
 
351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  30.09 
 
 
605 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.53 
 
 
688 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.63 
 
 
334 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2372  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.21 
 
 
335 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2272  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.42 
 
 
335 aa  170  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1972  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.03 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.26 
 
 
677 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4465  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.43 
 
 
699 aa  164  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211507  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.86 
 
 
354 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1706  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  30.33 
 
 
347 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4306  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.98 
 
 
329 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.264864  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.92 
 
 
351 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.86 
 
 
345 aa  155  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2702  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  28.23 
 
 
340 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2618  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  28.23 
 
 
340 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1590  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  28.23 
 
 
352 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>