More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1465 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1465  ferredoxin  100 
 
 		 647 aa  1325    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1200  ferredoxin  43.74 
 
 		 635 aa  501  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2795  ferredoxin  39.81 
 
 		 638 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1991  ferredoxin  38.3 
 
 		 644 aa  473  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.210098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1273  ferredoxin  39.23 
 
 		 627 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000139358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3100  ferredoxin  37.91 
 
 		 652 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0797  ferredoxin  39.47 
 
 		 657 aa  462  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0338  ferredoxin  40.48 
 
 		 622 aa  461  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0999  ferredoxin  36.6 
 
 		 650 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1193  ferredoxin  36.55 
 
 		 635 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0345672 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_608  iron-sulfur cluster binding protein  36.61 
 
 		 640 aa  422  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0873  ferredoxin  37.74 
 
 		 630 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0639  ferredoxin  35.67 
 
 		 640 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0670  iron-sulfur cluster binding protein  36.13 
 
 		 640 aa  415  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0704  iron-sulfur cluster binding protein  36.13 
 
 		 640 aa  415  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0806  ferredoxin  36.46 
 
 		 642 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0376213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3083  ferredoxin  36.91 
 
 		 529 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.144069  hitchhiker  0.000849503 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1384  ferredoxin  35.15 
 
 		 618 aa  372  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.809303  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0685  ferredoxin  36.19 
 
 		 627 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3310  ferredoxin  34.62 
 
 		 608 aa  363  8e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000109718  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3190  iron-sulfur cluster binding protein  38.02 
 
 		 521 aa  359  9.999999999999999e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1265  ferredoxin  36.02 
 
 		 535 aa  355  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1485  iron-sulfur cluster binding protein  36.67 
 
 		 537 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1042  ferredoxin  34.52 
 
 		 612 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.745403  normal  0.711049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0026  ferredoxin  32.92 
 
 		 647 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1368  ferredoxin  32.81 
 
 		 615 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.348316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3201  ferredoxin  30.67 
 
 		 614 aa  323  4e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2112  ferredoxin  32.16 
 
 		 612 aa  314  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1141  Fdx7  33.91 
 
 		 512 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3879  ferredoxin  32.32 
 
 		 616 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1438  vitamin B12 dependent methionine synthase, activation region  29.87 
 
 		 821 aa  312  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0601  ferredoxin  33.22 
 
 		 581 aa  312  1e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1786  ferredoxin  29.99 
 
 		 683 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262051 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15350  ferredoxin  32.2 
 
 		 598 aa  298  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2573  ferredoxin  30.77 
 
 		 615 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0428  ferredoxin  32.9 
 
 		 605 aa  288  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26170  uncharacterized metal-binding protein  32.85 
 
 		 606 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.911751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0420  hypothetical protein  29.84 
 
 		 610 aa  283  5.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1824  ferredoxin  29.97 
 
 		 592 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4322  ferredoxin  32.23 
 
 		 611 aa  280  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2787  ferredoxin  30.03 
 
 		 558 aa  279  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.978566  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0837  ferredoxin  31.33 
 
 		 592 aa  278  3e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.957001  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1680  hypothetical protein  30.45 
 
 		 690 aa  276  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.688529  normal  0.21865 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0078  ferredoxin  30.19 
 
 		 592 aa  273  6e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483879  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2766  hypothetical protein  29.74 
 
 		 673 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1409  ferredoxin  29.59 
 
 		 673 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0730  ferredoxin  29.49 
 
 		 570 aa  258  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.281306  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1226  ferredoxin  28.72 
 
 		 694 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.277788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1027  ferredoxin  29.22 
 
 		 673 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1974  ferredoxin  28.68 
 
 		 679 aa  248  2e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0649  hypothetical protein  30.02 
 
 		 612 aa  242  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.891312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2206  ferredoxin  33.18 
 
 		 539 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81671  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4341  ferredoxin  34.66 
 
 		 549 aa  231  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2906  hypothetical protein  32.86 
 
 		 424 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214584  normal  0.527616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1306  ferredoxin  32.78 
 
 		 538 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.661025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0608  hypothetical protein  30.79 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3525  uncharacterized metal-binding protein-like protein  30.17 
 
 		 417 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.467623 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3848  hypothetical protein  31.49 
 
 		 427 aa  177  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3459  uncharacterized metal-binding protein-like protein  30.26 
 
 		 417 aa  171  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2593  hypothetical protein  34.64 
 
 		 416 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0495  metal-binding protein  26.71 
 
 		 555 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0377737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2233  uncharacterized metal-binding protein  29.5 
 
 		 410 aa  143  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2076  ferredoxin  27.08 
 
 		 534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.083 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1398  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  27.79 
 
 		 685 aa  124  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2711  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  25.96 
 
 		 554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1370  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.18 
 
 		 540 aa  104  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3583  hypothetical protein  24.94 
 
 		 530 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395243  normal  0.0427775 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2745  ferredoxin  25.33 
 
 		 499 aa  98.6  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.168531  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0840  hypothetical protein  25.23 
 
 		 540 aa  95.1  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2035  ferredoxin  24.64 
 
 		 514 aa  95.1  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000915993  hitchhiker  0.000116196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0672  hypothetical protein  24.15 
 
 		 541 aa  93.6  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.56816 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1055  hypothetical protein  23.8 
 
 		 539 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0809  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.37 
 
 		 535 aa  84  0.000000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1835  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  23.41 
 
 		 639 aa  68.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.745354  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25350  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.82 
 
 		 407 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2165  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  29.82 
 
 		 407 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  34.17 
 
 		 333 aa  67  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  46.58 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0980  oxidoreductase FAD-binding region  41.86 
 
 		 327 aa  62.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3089  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.24 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14640  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  28.07 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.405931  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  40.24 
 
 		 597 aa  60.5  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  48.53 
 
 		 322 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0066  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.8 
 
 		 372 aa  60.1  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  48.53 
 
 		 322 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  48.53 
 
 		 322 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  48.53 
 
 		 322 aa  59.7  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  48.53 
 
 		 322 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  48.53 
 
 		 322 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  48.53 
 
 		 322 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1600  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  25.57 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00235477  normal  0.010966 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  48.53 
 
 		 322 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3052  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.94 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  48.53 
 
 		 322 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.94 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.158036  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2896  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.94 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00679398  normal  0.137352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30710  Multi-component phenol hydoxylase, reductase subunit; LapP  35.11 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431626  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3630  multidomain oxidoreductase  40.26 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2703  ferredoxin  34.48 
 
 		 89 aa  58.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163981  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1574  Na(+)-translocating NADH-quinone reductase subunit F  36.78 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>