More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3715 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3715  oxidoreductase FAD-binding subunit  100 
 
 
467 aa  956    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437326  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3690  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  83.26 
 
 
468 aa  797    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.53 
 
 
382 aa  226  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  32.77 
 
 
418 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.37 
 
 
414 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.01 
 
 
386 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  31.33 
 
 
382 aa  216  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  32.05 
 
 
380 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  32.69 
 
 
394 aa  200  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.19 
 
 
366 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.42 
 
 
368 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_004310  BR1462  NADH oxidoreductase, putative  29.52 
 
 
372 aa  188  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.345138  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.72 
 
 
366 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.77 
 
 
383 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.35 
 
 
380 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  31.35 
 
 
381 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.12 
 
 
381 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.12 
 
 
380 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.12 
 
 
380 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  31.12 
 
 
380 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.88 
 
 
366 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.98 
 
 
385 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.05 
 
 
381 aa  159  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.51 
 
 
367 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  34.26 
 
 
382 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  36.33 
 
 
366 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.26 
 
 
382 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71420  putative ferredoxin  36.33 
 
 
366 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.26 
 
 
382 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.26 
 
 
382 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.26 
 
 
382 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  35.89 
 
 
381 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  29.34 
 
 
379 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  35 
 
 
382 aa  156  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  35.74 
 
 
379 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.1 
 
 
390 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  33.2 
 
 
364 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1005  oxidoreductase FAD-binding protein  36.44 
 
 
368 aa  150  4e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5215  oxidoreductase FAD-binding region  33.33 
 
 
366 aa  149  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.11132  hitchhiker  0.00973319 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  32.92 
 
 
365 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2831  ferredoxin  27.21 
 
 
358 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0794308  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  33.74 
 
 
366 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1711  ferredoxin  31.37 
 
 
372 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.98 
 
 
375 aa  144  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0982  ferredoxin I  33.2 
 
 
362 aa  143  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.56 
 
 
585 aa  143  8e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.59 
 
 
375 aa  142  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.62 
 
 
375 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.53 
 
 
396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.18 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.93 
 
 
361 aa  136  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.02 
 
 
356 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3218  ferredoxin  30.04 
 
 
355 aa  133  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.33819  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2831  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.83 
 
 
376 aa  132  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926186  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2913  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.83 
 
 
380 aa  133  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  32.61 
 
 
662 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  25.83 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.8 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3010  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.47 
 
 
380 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.06 
 
 
677 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.35 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  32.55 
 
 
585 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.64 
 
 
388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1188  ferredoxin  29.5 
 
 
355 aa  130  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  24.43 
 
 
597 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.62 
 
 
363 aa  127  3e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1175  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.52 
 
 
371 aa  127  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3608  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.27 
 
 
403 aa  127  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  33.47 
 
 
356 aa  126  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.8 
 
 
406 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.49 
 
 
669 aa  123  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1261  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.77 
 
 
407 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  30.95 
 
 
606 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  30.95 
 
 
606 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1261  ferredoxin  29.44 
 
 
365 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.48547  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3979  ferredoxin  32.14 
 
 
353 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1364  iron-sulfur cluster-binding protein  31.16 
 
 
325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1358  ferredoxin  31.43 
 
 
376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1376  ferredoxin  31.43 
 
 
376 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1392  ferredoxin  31.43 
 
 
376 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  29.03 
 
 
627 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  25.32 
 
 
625 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.94 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  31.54 
 
 
605 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5978  ferredoxin  27.78 
 
 
364 aa  110  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.430172  normal  0.458682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  31.06 
 
 
368 aa  110  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.16 
 
 
345 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13259  oxidoreductase  31.21 
 
 
380 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.637455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4699  ferredoxin  31.03 
 
 
385 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148299  normal  0.0125208 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  31.82 
 
 
605 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1767  ferredoxin  32.14 
 
 
379 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.378919  normal  0.374649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  30.77 
 
 
350 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3622  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.4 
 
 
371 aa  106  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  22.51 
 
 
356 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  26.69 
 
 
670 aa  104  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5080  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  30.17 
 
 
682 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.644036  decreased coverage  0.000684551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1665  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  32.23 
 
 
334 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.212931  normal  0.785012 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  25.69 
 
 
702 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1052  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.92 
 
 
397 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.705726  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1068  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.68 
 
 
384 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.570837  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>