More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2176 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2176  ferredoxin  100 
 
 
130 aa  266  5e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.378228  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1737  ferredoxin  86.82 
 
 
129 aa  235  2e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  85.27 
 
 
129 aa  229  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0099  ferredoxin  87.6 
 
 
129 aa  210  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1779  ferredoxin  81.4 
 
 
129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  63.78 
 
 
681 aa  178  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  55.91 
 
 
415 aa  173  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1898  ferredoxin  57.38 
 
 
129 aa  143  8.000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0452  heat shock protein DnaJ domain protein  52.1 
 
 
209 aa  142  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0431  ferredoxin  50.77 
 
 
214 aa  141  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1615  ferredoxin  49.21 
 
 
218 aa  137  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.640152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  47.89 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0217  ferredoxin  44.44 
 
 
357 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  45.21 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  46.48 
 
 
99 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  45.21 
 
 
101 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  47.14 
 
 
96 aa  67.4  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  42.5 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  42.5 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  43.66 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  42.5 
 
 
99 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  42.25 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  42.25 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  41.77 
 
 
99 aa  66.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  41.25 
 
 
99 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  45.71 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  42.25 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  45.07 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  44.44 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  43.66 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  42.25 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.89 
 
 
358 aa  63.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  37.8 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2886  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase  37.04 
 
 
366 aa  62.4  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00113682  decreased coverage  0.000127414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2520  ferredoxin  36.36 
 
 
366 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0757  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.51 
 
 
358 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123298  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  30.93 
 
 
361 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09201  ferredoxin  46.15 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.354651  hitchhiker  0.00000103216 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  40.85 
 
 
100 aa  60.5  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3352  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.19 
 
 
358 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2143  ferredoxin  31.45 
 
 
344 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000191342  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.91 
 
 
357 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  40.85 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  40.85 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  46.03 
 
 
123 aa  58.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  42.19 
 
 
103 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4151  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.83 
 
 
358 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.522682  normal  0.83112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  35.14 
 
 
351 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0608  ferredoxin reductase protein  38.03 
 
 
363 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  39.73 
 
 
122 aa  58.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2468  ferredoxin  38.36 
 
 
344 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4563  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.13 
 
 
364 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.659135 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.27 
 
 
362 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3491  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.13 
 
 
364 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.168778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3808  ferredoxin  40.96 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0641293  normal  0.164751 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05340  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaK subunit  39.39 
 
 
357 aa  57.8  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000116603  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3822  ferredoxin  40.96 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.654022  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3896  ferredoxin  40.96 
 
 
105 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699938  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  39.19 
 
 
94 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  39.44 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03005  Phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.33 
 
 
349 aa  57  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  33.77 
 
 
350 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7195  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.67 
 
 
358 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  40.85 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  40.85 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0508  ferredoxin  35.53 
 
 
350 aa  56.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.303507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.46 
 
 
360 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0932  ferredoxin  32.58 
 
 
358 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  36 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2391  ferredoxin  38.96 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162374  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2869  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase paaE  36.36 
 
 
337 aa  55.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.236927 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1342  (2Fe-2S) ferredoxin  36.62 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.584075  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0310  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.02 
 
 
339 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3637  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.8 
 
 
365 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  35.9 
 
 
356 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0319  ferredoxin  34.83 
 
 
346 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0329  ferredoxin  34.83 
 
 
346 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  34.34 
 
 
352 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  35.62 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  41.54 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  37.5 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1059  ferredoxin (2Fe-2S)  37.04 
 
 
106 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  37.04 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  39.44 
 
 
122 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4306  oxidoreductase FAD-binding subunit  36.36 
 
 
329 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.264864  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  36.62 
 
 
104 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1903  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  34.18 
 
 
368 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.18 
 
 
585 aa  54.7  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  41.18 
 
 
348 aa  54.3  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.19 
 
 
358 aa  54.3  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0037  ferredoxin  37.5 
 
 
200 aa  54.3  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.92312  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4257  ferredoxin  39.44 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118014  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.62 
 
 
358 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.62 
 
 
358 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1462  ferredoxin  37.1 
 
 
358 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611989  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0377  ferredoxin  39.39 
 
 
350 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.88135 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13587  electron transfer protein fdxB  35.9 
 
 
685 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.117181  normal  0.115848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.62 
 
 
358 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.62 
 
 
358 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  42.37 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>