More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1591 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1591  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  298  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3794  ferredoxin (2Fe-2S)  34.31 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  36.05 
 
 		 123 aa  66.6  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  35.63 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  38.2 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  37.23 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  37.23 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0338  ferredoxin (2Fe-2S)  47.89 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  34.44 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2779  ferredoxin (2Fe-2S)  32.97 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3322  ferredoxin (2Fe-2S)  32.97 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.466379 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  37.93 
 
 		 99 aa  62.8  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3426  ferredoxin  41.56 
 
 		 351 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  34.09 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  33.72 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  37.35 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  37.84 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  36.26 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10664  predicted protein  38.37 
 
 		 93 aa  60.5  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00108435  normal  0.864403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  37.93 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  41.1 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  35.79 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  35.79 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  28.16 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4458  ferredoxin (2Fe-2S)  32.61 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0319  ferredoxin  34.34 
 
 		 346 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0329  ferredoxin  34.34 
 
 		 346 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  35.79 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  37.84 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0310  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.54 
 
 		 339 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0320  ferredoxin  42.86 
 
 		 348 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.22 
 
 		 385 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  34.48 
 
 		 99 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  33.7 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  31.52 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14011  hypothetical protein  37.08 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.908602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  37.84 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  27.37 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  38.36 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  35.14 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  36.99 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  32.94 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  36.99 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  37.5 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.34 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  35.9 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2296  ferredoxin (2Fe-2S)  44.29 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0599  ferredoxin  35.96 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  39.73 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  39.73 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  37.68 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1977  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.79 
 
 		 357 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.102774  normal  0.0121969 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.43 
 
 		 382 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0543  ferredoxin  36.62 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032188 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  31.87 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  31.87 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.33 
 
 		 381 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1542  ferredoxin (2Fe-2S)  28.44 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.847794  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16391  ferredoxin  31.82 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.342589  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  36.23 
 
 		 380 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  35.53 
 
 		 268 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16511  ferredoxin  31.82 
 
 		 108 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  36.23 
 
 		 381 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8367  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.98 
 
 		 368 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283196  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1580  ferredoxin (2Fe-2S)  37.04 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66831  normal  0.0183824 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  36.23 
 
 		 380 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  34.25 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3846  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.18 
 
 		 346 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.111631  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2185  ferredoxin (2Fe-2S)  36.47 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.558504 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  38.75 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  29.76 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  34.94 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  31.4 
 
 		 414 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.78 
 
 		 341 aa  53.9  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2893  ferredoxin  39.68 
 
 		 347 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200106  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.78 
 
 		 381 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.78 
 
 		 380 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.78 
 
 		 380 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  34.78 
 
 		 380 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.22 
 
 		 375 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  36.36 
 
 		 382 aa  52.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.03 
 
 		 363 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3180  ferredoxin  37.84 
 
 		 365 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  31.11 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.83 
 
 		 350 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  34.18 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.96 
 
 		 356 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.83 
 
 		 350 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.22 
 
 		 375 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  27 
 
 		 382 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  34.72 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  33.33 
 
 		 386 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  33.33 
 
 		 382 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  30.43 
 
 		 343 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  27 
 
 		 382 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  34.72 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3782  ferredoxin  30.53 
 
 		 352 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00690243  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  27 
 
 		 382 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0279  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  32.31 
 
 		 336 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.280982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1087  ferredoxin  30.77 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>