More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1052 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1052  oxidoreductase FAD-binding subunit  100 
 
 
397 aa  810    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.705726  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1068  oxidoreductase FAD-binding subunit  58.01 
 
 
384 aa  445  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.570837  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2468  oxidoreductase FAD-binding region  34.51 
 
 
625 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.82591  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.97 
 
 
669 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2337  hypothetical protein  29.3 
 
 
627 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  29.48 
 
 
585 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.49 
 
 
383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  30.43 
 
 
605 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4814  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  30.68 
 
 
386 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.501777  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.85 
 
 
702 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  28.88 
 
 
597 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.61 
 
 
688 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4844  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.19 
 
 
356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0431343 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5288  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.07 
 
 
363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.632487  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6856  ferredoxin  30.92 
 
 
381 aa  147  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  31.88 
 
 
351 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5014  oxidoreductase FAD-binding subunit  30 
 
 
382 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240099  normal  0.858048 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4489  oxidoreductase FAD-binding subunit  30 
 
 
382 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.320814  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  28.34 
 
 
670 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_003296  RS02038  ferredoxin oxidoreductase protein  29.66 
 
 
382 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.365456 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  30.05 
 
 
605 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5208  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.71 
 
 
382 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2855  ferredoxin  29.66 
 
 
394 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3295  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.62 
 
 
385 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27905  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3291  oxidoreductase FAD-binding region  29.71 
 
 
382 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5077  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.71 
 
 
382 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0579  ferredoxin/oxidoreductase  30 
 
 
382 aa  142  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3554  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.71 
 
 
382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6898  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  28 
 
 
677 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  30.34 
 
 
379 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1166  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.61 
 
 
367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1002  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.9 
 
 
363 aa  139  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0859657  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  27.4 
 
 
365 aa  139  8.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3723  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  30.49 
 
 
358 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3096  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  25.13 
 
 
387 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.592741  normal  0.0476829 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0748  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.88 
 
 
380 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2116  iron-sulfur cluster-binding protein  30.88 
 
 
381 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.53 
 
 
585 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0896  iron-sulfur cluster-binding protein  28.86 
 
 
356 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.844973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.91 
 
 
356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1577  putative ferredoxin oxidoreductase protein  29.84 
 
 
418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.75 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0836  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.59 
 
 
380 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0319  ferredoxin  32.2 
 
 
346 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0329  ferredoxin  32.2 
 
 
346 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  30.91 
 
 
351 aa  135  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0479  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.59 
 
 
381 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1056  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.92 
 
 
374 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0998  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.59 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0388253  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1971  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.59 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.851205  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0702  putative ferredoxin, 2Fe-2S  30.59 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.54952  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  27.2 
 
 
373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5071  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.63 
 
 
414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407916  hitchhiker  0.00354835 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0484  ferredoxin  26.56 
 
 
364 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0316  oxidoreductase FAD-binding domain protein  29.14 
 
 
368 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.482566  decreased coverage  0.00002417 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1217  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.39 
 
 
406 aa  133  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640214  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0337  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.75 
 
 
366 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00256748  normal  0.662502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5309  ferredoxin  28.77 
 
 
356 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1294  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.59 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.87 
 
 
375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2674  ferredoxin  32.94 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333884  normal  0.0191308 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4775  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.33 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.05576 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.76 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0339  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.79 
 
 
366 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0495555  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4891  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.05 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0931607  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4115  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.79 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  27.64 
 
 
375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4136  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.67 
 
 
367 aa  130  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1462  ferredoxin  28.34 
 
 
358 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.611989  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  26.93 
 
 
348 aa  129  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0402  iron-sulfur cluster-binding protein  27.22 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501485  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4230  FHA domain containing protein  29.4 
 
 
606 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1070  oxidoreductase FAD-binding subunit  24.93 
 
 
361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4292  FHA domain containing protein  29.4 
 
 
606 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.168951  normal  0.224479 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2724  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.7 
 
 
322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13604  hemoglobine-related protein hmp  29.86 
 
 
358 aa  127  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.714491  normal  0.806459 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1003  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.05 
 
 
323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1860  iron-sulfur cluster-binding protein  29.39 
 
 
379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1053  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.05 
 
 
323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1033  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.7 
 
 
322 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0971  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.05 
 
 
323 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1034  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.05 
 
 
323 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0976  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.7 
 
 
322 aa  126  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  27.82 
 
 
354 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0936  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.05 
 
 
323 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4186  ferredoxin  30.32 
 
 
346 aa  125  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00877  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.7 
 
 
322 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2770  ferredoxin  31.7 
 
 
322 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0945  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.7 
 
 
322 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.968361  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0901  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.7 
 
 
322 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.843947 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00883  hypothetical protein  31.7 
 
 
322 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2459  HCP oxidoreductase, NADH-dependent  31.7 
 
 
322 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1416  ferredoxin  29.6 
 
 
353 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2665  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.14 
 
 
396 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.202569  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0310  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.68 
 
 
339 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2893  ferredoxin  29.53 
 
 
347 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200106  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  32.76 
 
 
232 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.08 
 
 
341 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2520  ferredoxin  29.57 
 
 
366 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6200  putative ferredoxin  27.71 
 
 
366 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>