More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1615 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1615  ferredoxin  100 
 
 
218 aa  436  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.640152 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0431  ferredoxin  53.7 
 
 
214 aa  228  6e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0452  heat shock protein DnaJ domain protein  49.32 
 
 
209 aa  211  9e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  46.15 
 
 
415 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1737  ferredoxin  47.62 
 
 
129 aa  128  5.0000000000000004e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  47.62 
 
 
129 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2176  ferredoxin  49.21 
 
 
130 aa  125  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.378228  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  37.14 
 
 
681 aa  105  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1779  ferredoxin  47.62 
 
 
129 aa  105  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0099  ferredoxin  48.41 
 
 
129 aa  102  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1898  ferredoxin  42.86 
 
 
129 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  45.95 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  45.95 
 
 
122 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  43.28 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  45.31 
 
 
99 aa  65.1  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3728  ferredoxin  39.44 
 
 
356 aa  65.1  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.600358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  45.31 
 
 
99 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  44.78 
 
 
104 aa  63.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.58 
 
 
358 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0217  ferredoxin  34.21 
 
 
357 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  33.94 
 
 
345 aa  63.2  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2780  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.23 
 
 
362 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0478602  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0245  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.23 
 
 
362 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0326  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.23 
 
 
362 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0254  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.23 
 
 
362 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0292434  normal  0.0307686 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  42.86 
 
 
99 aa  62.4  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0306  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.23 
 
 
362 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.144813  hitchhiker  0.000507312 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  43.28 
 
 
122 aa  62  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  45.9 
 
 
366 aa  62  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0651  ferredoxin  35.14 
 
 
353 aa  61.6  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  41.67 
 
 
122 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2253  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.66 
 
 
356 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1577  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.66 
 
 
356 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1479  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.66 
 
 
356 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0228  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.23 
 
 
362 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0180747  hitchhiker  0.0014836 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2391  ferredoxin  31.18 
 
 
109 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162374  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2263  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.66 
 
 
356 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.379907  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3425  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.33 
 
 
362 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0901107  normal  0.882381 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0902  ferredoxin, petF-like protein  37.84 
 
 
124 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.180357  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  42.86 
 
 
122 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  33.73 
 
 
99 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  43.48 
 
 
122 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  42.25 
 
 
351 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  43.48 
 
 
122 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  43.28 
 
 
89 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4509  ferredoxin (2Fe-2S)  35.94 
 
 
97 aa  60.1  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.567791  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2861  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.88 
 
 
362 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3739  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.14 
 
 
358 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184178  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09801  ferredoxin, petF-like protein  37.31 
 
 
124 aa  59.7  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  40.62 
 
 
99 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1223  oxidoreductase  40 
 
 
343 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.256584  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  40.62 
 
 
99 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  40.62 
 
 
99 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  40.62 
 
 
99 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  40.3 
 
 
99 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2542  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.73 
 
 
344 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261713  hitchhiker  0.0000462807 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  40.62 
 
 
99 aa  59.3  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2577  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  35.71 
 
 
362 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.616553  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3533  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  35.71 
 
 
362 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3840  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.71 
 
 
362 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0011  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.71 
 
 
362 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3115  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  35.71 
 
 
362 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136188  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3779  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.71 
 
 
362 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0589683  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1980  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  35.71 
 
 
362 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.144649  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  43.28 
 
 
101 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0008  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.71 
 
 
362 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0203524  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  42.19 
 
 
99 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0932  ferredoxin  29.76 
 
 
358 aa  58.9  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4257  ferredoxin  32.88 
 
 
111 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118014  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7195  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.67 
 
 
358 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  38.46 
 
 
99 aa  58.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  40.28 
 
 
94 aa  58.5  0.00000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 
104 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  40.62 
 
 
98 aa  58.5  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  40 
 
 
104 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1882  ferredoxin (2Fe-2S)  43.75 
 
 
103 aa  58.2  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.185492  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0291  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  33.33 
 
 
362 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2520  ferredoxin  38.89 
 
 
366 aa  58.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.49 
 
 
358 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4804  ferredoxin (2Fe-2S)  40.3 
 
 
99 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1416  ferredoxin  39.44 
 
 
353 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  37.33 
 
 
358 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  43.28 
 
 
99 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3101  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.71 
 
 
362 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0125326  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.49 
 
 
358 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.49 
 
 
358 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3666  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.88 
 
 
362 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100364  hitchhiker  0.000000384073 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  43.28 
 
 
99 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.71 
 
 
351 aa  57.8  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09631  ferredoxin, petF-like protein  38.81 
 
 
124 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4151  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.77 
 
 
358 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.522682  normal  0.83112 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  38.89 
 
 
360 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.24 
 
 
357 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  42.65 
 
 
362 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  33.8 
 
 
361 aa  56.6  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1546  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  32.88 
 
 
354 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729888  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1502  ferredoxin  31.58 
 
 
365 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1828  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  42.65 
 
 
362 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488384  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1195  heat shock protein DnaJ domain protein  54.55 
 
 
248 aa  55.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3352  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.76 
 
 
358 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>