More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1898 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1898  ferredoxin  100 
 
 
129 aa  257  5.0000000000000005e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0856  ferredoxin  60.66 
 
 
129 aa  154  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1737  ferredoxin  57.38 
 
 
129 aa  149  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2176  ferredoxin  57.38 
 
 
130 aa  140  6e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.378228  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1779  ferredoxin  55.74 
 
 
129 aa  137  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  52.94 
 
 
415 aa  135  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0099  ferredoxin  57.38 
 
 
129 aa  136  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3256  serine/threonine protein kinase  50.43 
 
 
681 aa  122  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400269  normal  0.0118767 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1615  ferredoxin  43.7 
 
 
218 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.640152 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0431  ferredoxin  42.5 
 
 
214 aa  108  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0452  heat shock protein DnaJ domain protein  40.34 
 
 
209 aa  107  6e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0217  ferredoxin  43.06 
 
 
357 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0184042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0882  ferredoxin (2Fe-2S)  38.55 
 
 
99 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869731  hitchhiker  0.00155176 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  36.99 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  36.99 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  36.99 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  36.99 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  35.14 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  38.03 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  35.62 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  35.62 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  35.14 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0914  ferredoxin (2Fe-2S)  39.73 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  35.62 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5128  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.84 
 
 
351 aa  56.6  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243235  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  34.25 
 
 
99 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  42.25 
 
 
89 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  32.89 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  34.78 
 
 
361 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0310  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.94 
 
 
339 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1772  ferredoxin (2Fe-2S)  32.93 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  42.25 
 
 
101 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  40.28 
 
 
348 aa  55.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2886  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase  32.91 
 
 
366 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00113682  decreased coverage  0.000127414 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0319  ferredoxin  37.5 
 
 
346 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  39.44 
 
 
351 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0329  ferredoxin  37.5 
 
 
346 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.106229 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4051  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.5 
 
 
342 aa  54.7  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.548606  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0508  ferredoxin  35.53 
 
 
350 aa  53.9  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.303507 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0882  ferredoxin  39.44 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0891946  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1691  oxidoreductase FAD-binding region  38.89 
 
 
327 aa  54.3  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0151  putative ferredoxin  45.59 
 
 
87 aa  54.3  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0245789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2520  ferredoxin  32.56 
 
 
366 aa  53.9  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1060  ferredoxin (2Fe-2S)  35.06 
 
 
102 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000352883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1205  ferredoxin (2Fe-2S)  35.14 
 
 
99 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0687  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  39.74 
 
 
360 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.475559  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37765  predicted protein  34.25 
 
 
123 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.699954  normal  0.0237321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1234  ferredoxin (2Fe-2S)  35.62 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.128018  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4285  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.79 
 
 
362 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481656  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0999  ferredoxin (2Fe-2S)  36.84 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0221545  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  36.84 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  36.84 
 
 
122 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3306  oxidoreductase FAD-binding subunit  40.28 
 
 
353 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592709  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0291  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  31.48 
 
 
362 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0915  ferredoxin (2Fe-2S)  36.36 
 
 
100 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0228  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.66 
 
 
362 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0180747  hitchhiker  0.0014836 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1533  ferredoxin (2Fe-2S)  27.91 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.68916 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3425  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.67 
 
 
362 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0901107  normal  0.882381 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3666  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.56 
 
 
362 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100364  hitchhiker  0.000000384073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1796  ferredoxin (2Fe-2S)  35.37 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1824  ferredoxin (2Fe-2S)  35.37 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4145  ferredoxin (2Fe-2S)  34.15 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2108  ferredoxin (2Fe-2S)  34.15 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000588176 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0010  ferredoxin  41.67 
 
 
342 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.484136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0909  ferredoxin  35.37 
 
 
113 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.911704  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2869  putative phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase paaE  36.26 
 
 
337 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.236927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3352  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.78 
 
 
358 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  42.86 
 
 
122 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3637  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.68 
 
 
365 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05340  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaK subunit  37.88 
 
 
357 aa  50.4  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000116603  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08810  Phenol hydroxylase, Ferredoxin subunit  38.89 
 
 
353 aa  50.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4806  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.11 
 
 
358 aa  50.1  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.234643 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  32.14 
 
 
350 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18640  flavodoxin reductase family protein  32.56 
 
 
355 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1828  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.68 
 
 
362 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488384  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1326  oxidoreductase FAD-binding region  36.84 
 
 
354 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47390  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.43 
 
 
322 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3238  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.38 
 
 
338 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  34.38 
 
 
366 aa  50.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  36.36 
 
 
585 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2577  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  33.33 
 
 
362 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.616553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2303  ferredoxin (2Fe-2S)  32.84 
 
 
268 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0830078  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.03 
 
 
345 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0011  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.33 
 
 
362 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3115  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  33.33 
 
 
362 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136188  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2771  ferredoxin  36.51 
 
 
318 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450924 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1088  ferredoxin (2Fe-2S)  32.99 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3533  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  33.33 
 
 
362 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1980  phenylacetic acid degradation NADH oxidoreductase PaaE  33.33 
 
 
362 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.144649  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2861  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32 
 
 
362 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0757  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  35.71 
 
 
358 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123298  normal  0.178298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0900  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  43.08 
 
 
389 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.76 
 
 
338 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4151  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.78 
 
 
358 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.522682  normal  0.83112 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  36.76 
 
 
338 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1903  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.33 
 
 
368 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2893  ferredoxin  31.88 
 
 
347 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200106  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3840  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.33 
 
 
362 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3779  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.33 
 
 
362 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0589683  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0008  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.33 
 
 
362 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0203524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>